RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP23.79■■□□□ 1.4
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USP36-218ENST00000590546 CAPNS2Q96L46 248 aa23.79■■□□□ 1.4
USP36-218ENST00000590546 SDCBP2Q9H190 292 aa23.79■■□□□ 1.4
USP36-218ENST00000590546 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa23.79■■□□□ 1.4
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USP36-218ENST00000590546 TRPV2Q9Y5S1 764 aa23.79■■□□□ 1.4
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USP36-218ENST00000590546 SLC4A11Q8NBS3 891 aa23.78■■□□□ 1.4
USP36-218ENST00000590546 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
USP36-218ENST00000590546 AP1M1Q9BXS5 423 aa23.78■■□□□ 1.4
USP36-218ENST00000590546 ACBD3Q9H3P7 528 aa23.78■■□□□ 1.4
USP36-218ENST00000590546 IP6K2Q9UHH9 426 aa23.78■■□□□ 1.4
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USP36-218ENST00000590546 CST5P28325 142 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
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USP36-218ENST00000590546 WHAMMQ8TF30 809 aa23.78■■□□□ 1.4
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USP36-218ENST00000590546 SERINC5Q86VE9 423 aa23.76■■□□□ 1.39
USP36-218ENST00000590546 WDTC1Q8N5D0 677 aa23.76■■□□□ 1.39
USP36-218ENST00000590546 NT5C1AQ9BXI3 368 aa23.76■■□□□ 1.39
USP36-218ENST00000590546 ELOVL4Q9GZR5 314 aa23.76■■□□□ 1.39
USP36-218ENST00000590546 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.76■■□□□ 1.39
USP36-218ENST00000590546 CHST12Q9NRB3 414 aa23.76■■□□□ 1.39
USP36-218ENST00000590546 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
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USP36-218ENST00000590546 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
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USP36-218ENST00000590546 C3orf20Q8ND61 904 aa23.75■■□□□ 1.39
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USP36-218ENST00000590546 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
USP36-218ENST00000590546 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.75■■□□□ 1.39
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USP36-218ENST00000590546 MIS12Q9H081 205 aa23.75■■□□□ 1.39
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USP36-218ENST00000590546 PARP2Q9UGN5 583 aa23.75■■□□□ 1.39
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USP36-218ENST00000590546 DCUN1D2Q6PH85 259 aa23.74■■□□□ 1.39
USP36-218ENST00000590546 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
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USP36-218ENST00000590546 RNF186Q9NXI6 227 aa23.74■■□□□ 1.39
USP36-218ENST00000590546 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.397e-6■■■■■ 27.7
USP36-218ENST00000590546 TRIP11Q15643 1979 aa23.74■■□□□ 1.39
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