RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 EFCAB13Q8IY85 973 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 RASSF8Q8NHQ8 419 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 PSMG2Q969U7 264 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 EPSTI1Q96J88 318 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 ZFYVE19Q96K21 471 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 LMAN1LQ9HAT1 526 aa13.11□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 CYP4F8P98187 520 aa13.1□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 ADALQ6DHV7 355 aa13.1□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa13.1□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 TTC8Q8TAM2 541 aa13.1□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 TSPAN18Q96SJ8 248 aa13.1□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 PARD6AQ9NPB6 346 aa13.1□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 C2orf42Q9NWW7 574 aa13.1□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 CLIC4Q9Y696 253 aa13.1□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 CHADO15335 359 aa13.09□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 PPP1R37O75864 691 aa13.09□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 BMP15O95972 392 aa13.09□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 PTPAQ15257 358 aa13.09□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 DYMQ7RTS9 669 aa13.09□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 LRRTM3Q86VH5 581 aa13.09□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 GTSE1Q9NYZ3 720 aa13.09□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 C2CD2Q9Y426 696 aa13.09□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 ASB3Q9Y575 518 aa13.09□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 ATG2BQ96BY7 2078 aa13.09□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 SDK1Q7Z5N4 2213 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 CYB561D2O14569 222 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 TAF6P49848 677 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 CCR3P51677 355 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 CASP5P51878 434 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 FAM173BQ6P4H8 233 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 MAMSTRQ6ZN01 415 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 ZNF720Q7Z2F6 126 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 TMEM150AQ86TG1 271 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa13.08□□□□□ -0.32
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CTIF-208ENST00000590422 BORCS6Q96GS4 357 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 IER2Q9BTL4 223 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 STRA6Q9BX79 667 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 ASB7Q9H672 318 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 TMLHEQ9NVH6 421 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 DPP3Q9NY33 737 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 TBC1D7Q9P0N9 293 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 HSFX1Q9UBD0 423 aa13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 TPRP12270 2363 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 MYBPHLA2RUH7 354 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 MYMKA6NI61 221 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 K7ESF4 209 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 DDIT3P35638 169 aa13.07□□□□□ -0.32
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