RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 SEPT14Q6ZU15 432 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 MICU3Q86XE3 530 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 TOX2Q96NM4 488 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 CSRNP2Q9H175 543 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 STARD7Q9NQZ5 370 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 PXMP2Q9NR77 195 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 PDRG1Q9NUG6 133 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 COL20A1Q9P218 1284 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 ST14Q9Y5Y6 855 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1W2PQY0 241 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 MEGF11A6BM72 1044 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GOLGA8AA7E2F4 631 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GOLGA8BA8MQT2 603 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 MEIS2O14770 477 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 TPP1O14773 563 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CTAGE5O15320 804 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ADCY6O43306 1168 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 NBNO60934 754 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 NOS3P29474 1203 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 LSP1P33241 339 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 LTBRP36941 435 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR3P46089 330 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CDK7P50613 346 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 BEX3Q00994 111 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 POU4F1Q01851 419 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 TLE2Q04725 743 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SCRN1Q12765 414 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SNX17Q15036 470 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PGM5Q15124 567 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 TERF2Q15554 542 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 KIZQ2M2Z5 673 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 IQCEQ6IPM2 695 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 XRRA1Q6P2D8 792 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PGBD4Q96DM1 585 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GLT8D2Q9H1C3 349 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 DGKBQ9Y6T7 804 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CEP290O15078 2479 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 MYADML2A6NDP7 307 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SMCO2A6NFE2 343 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 F5H423 210 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 STAM2O75886 525 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GH1P01241 217 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GRK2P25098 689 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CCND2P30279 289 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 BMP8BP34820 402 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ETV3P41162 512 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CPT1AP50416 773 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 LY6KQ17RY6 165 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 TLK2Q86UE8 772 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 NLRX1Q86UT6 975 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 OR6J1Q8NGC5 347 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 FRS2Q8WU20 508 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 TEKT5Q96M29 485 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 TGM5O43548 720 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 IFNAR1P17181 557 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SYN1P17600 705 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 RENBPP51606 427 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ADKP55263 362 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SCAND1P57086 179 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM193AP78312 1265 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms