RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	ADCY5	O95622	1261 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	PLCB2	Q00722	1185 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	DSG1	Q02413	1049 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	DPH6	Q7L8W6	267 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	APPL2	Q8NEU8	664 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	SPATA18	Q8TC71	538 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	CISH	Q9NSE2	258 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	PTPRD	P23468	1912 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	ADAM12	O43184	909 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	HUS1	O60921	280 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	TPM3	P06753	285 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	CTSA	P10619	480 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	P4HA1	P13674	534 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	CD58	P19256	250 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	LMO2	P25791	158 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	CDC25B	P30305	580 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	IRS1	P35568	1242 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	GLUD2	P49448	558 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	ERVFC1	P60507	584 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	UBE3A	Q05086	875 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	ORC1	Q13415	861 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	NEK11	Q8NG66	645 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	POF1B	Q8WVV4	589 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	LRCH3	Q96II8	777 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	MMS19	Q96T76	1030 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	CEP72	Q9P209	647 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	DSE	Q9UL01	958 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
DNMT1-208	ENST00000586667	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667		A0A1W2PQJ5	194 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	VNN2	O95498	520 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM163B	P0C2L3	166 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	MRE11	P49959	708 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	NDST1	P52848	882 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	RAD23B	P54727	409 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	GPM6B	Q13491	265 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM209	Q96SK2	561 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF576	Q9H609	170 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	TLR9	Q9NR96	1032 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	HIDE1	A8MVS5	230 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	RFXAP	O00287	272 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	CLSTN1	O94985	981 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	CALCA	P01258	141 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	UROD	P06132	367 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	KRT17	Q04695	432 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	ARID5B	Q14865	1188 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DNMT1-208	ENST00000586667	PSMD5	Q16401	504 aa		13.44	□□□□□ -0.26

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