RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584216.5

COPS3-218, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene COPS3, Length 876 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-218ENST00000584216 LRRC3BQ96PB8 259 aa14.51□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.51□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 C2orf42Q9NWW7 574 aa14.51□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.51□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 TTC26A0AVF1 554 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 E9PMD0 336 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 RHOBTB1O94844 696 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 LARGE1O95461 756 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 PRAMEF12O95522 483 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 PLS3P13797 630 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 GUCY2CP25092 1073 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 AVPR1AP37288 418 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 GUCY1B3Q02153 619 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 SMARCB1Q12824 385 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 FBXO43Q4G163 708 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 SEZ6Q53EL9 994 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 BICD1Q96G01 975 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 DSEQ9UL01 958 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 USP24Q9UPU5 2620 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 LAD1O00515 517 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 DRD1P21728 446 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 SCP2P22307 547 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 PXNP49023 591 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 BFSP1Q12934 665 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 MAPK7Q13164 816 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 RUNX3Q13761 415 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 ZBTB6Q15916 424 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 C11orf74Q86VG3 221 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 GKN1Q9NS71 199 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 KCND2Q9NZV8 630 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 SOBPA7XYQ1 873 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 LILRA4P59901 499 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 CYP4F8P98187 520 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 SPAG1Q07617 926 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 PLK5Q496M5 336 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 METTL23Q86XA0 190 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 CD302Q8IX05 232 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 ACDQ96AP0 544 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 EDEM2Q9BV94 578 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 SFI1A8K8P3 1242 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 RNF40O75150 1001 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 SOAT2O75908 522 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 PRPHP41219 470 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 LIG4P49917 911 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 PDGFRLQ15198 375 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 SPATA1Q5VX52 437 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 SENP8Q96LD8 212 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 LPIN3Q9BQK8 851 aa14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 LACTBL1A8MY62 500 aa14.46□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 OGTO15294 1046 aa14.46□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 APBB3O95704 486 aa14.46□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 CAVIN2O95810 425 aa14.46□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 CYP11A1P05108 521 aa14.46□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 ABCD1P33897 745 aa14.46□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 NEK4P51957 841 aa14.46□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 CREB5Q02930 508 aa14.46□□□□□ -0.09
COPS3-218ENST00000584216 SYT13Q7L8C5 426 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms