RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568900.5

SPNS1-212, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2

Gene SPNS1, Length 2,253 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-212ENST00000568900 KRT35Q92764 455 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 RAB21Q9UL25 225 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 NOD1Q9Y239 953 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 FKTNO75072 461 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 KCNE1P15382 129 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 VSNL1P62760 191 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 XKR4Q5GH76 650 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 WDTC1Q8N5D0 677 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 ALG3Q92685 438 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 MARCKSL1P49006 195 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 NDST1P52848 882 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 INCA1Q0VD86 236 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 CABYRO75952 493 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 MAMLD1Q13495 774 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 CARD9Q9H257 536 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF446Q9NWS9 450 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 CD4P01730 458 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 BRD3Q15059 726 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 DPH6Q7L8W6 267 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 SCINQ9Y6U3 715 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC151A5D8V7 595 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 MYO1FO00160 1098 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 GPR182O15218 404 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 GJB6O95452 261 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 CALB1P05937 261 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 TTC39CQ8N584 583 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 CD101Q93033 1021 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 GHRP10912 638 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 YY1P25490 414 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 ERICH1Q86X53 443 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 ZFP42Q96MM3 310 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 CHST12Q9NRB3 414 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 PARVAQ9NVD7 372 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 PIRO00625 290 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 ZMYND10O75800 440 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 VDRP11473 427 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 CD52P31358 61 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 PTK7Q13308 1070 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 C8orf74Q6P047 294 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 WDR93Q6P2C0 686 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 KRT12Q99456 494 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 HINFPQ9BQA5 517 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 LHX5Q9H2C1 402 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 TMEM59LQ9UK28 342 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 FGGP02679 453 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 TUBBP07437 444 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 GRK4P32298 578 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 PEX5P50542 639 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 ARHGEF6Q15052 776 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 SGO2Q562F6 1265 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 LHX8Q68G74 356 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 PADI3Q9ULW8 664 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 PTGESO14684 152 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 MICAL2O94851 1124 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 ITGA4P13612 1032 aa22.14■■□□□ 1.14
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