RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 F5P12259 2224 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 PROB1E7EW31 1015 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 LDHAP00338 332 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 F13A1P00488 732 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 GLULP15104 373 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 ALDH1A3P47895 512 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 PRKCQQ04759 706 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 TEAD2Q15562 447 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 SV2CQ496J9 727 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 WSCD1Q658N2 575 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 METTL23Q86XA0 190 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 BORCS6Q96GS4 357 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 LRRC3Q9BY71 257 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 TRIM9Q9C026 710 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 CUEDC2Q9H467 287 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 ZFP14Q9HCL3 533 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 FRYLO94915 3013 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 KANSL1LA0AUZ9 987 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 KPNA7A9QM74 516 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 ITGB3P05106 788 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 CD72P21854 359 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 ASIC1P78348 528 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 C1orf127Q8N9H9 656 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF560Q96MR9 790 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM206Q9H813 350 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 A0A1W2PRU2 124 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 EXTL3O43909 919 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 PKP1Q13835 747 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 UBXN2BQ14CS0 331 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 SCARA3Q6AZY7 606 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 VITQ6UXI7 678 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 TPRG1Q6ZUI0 275 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 ASCL5Q7RTU5 278 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 SMARCD2Q92925 531 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 PDE11AQ9HCR9 933 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 HEBP1Q9NRV9 189 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 AGAP1Q9UPQ3 857 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 NCANO14594 1321 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 VIPR2P41587 438 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 THEM5Q8N1Q8 247 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 GPD1LQ8N335 351 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 IQUBQ8NA54 791 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 PSMG2Q969U7 264 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 BRD9Q9H8M2 597 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 PRR23AA6NEV1 266 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 AMPD3Q01432 767 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 MGAT5BQ3V5L5 792 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 STXBP5Q5T5C0 1151 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 LRRTM3Q86VH5 581 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 LPIN3Q9BQK8 851 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 MTMR12Q9C0I1 747 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 LTB4R2Q9NPC1 389 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 ASB3Q9Y575 518 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 ATF6P18850 670 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 CASP1P29466 404 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 HOXD13P35453 343 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 PNPLA4P41247 253 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 BFSP1Q12934 665 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 GAREM2Q75VX8 874 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 CXorf38Q8TB03 319 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 TRPV4Q9HBA0 871 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 HSFX1Q9UBD0 423 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 PTPRDP23468 1912 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF292O60281 2723 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 PTPRJQ12913 1337 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 SPTBN4Q9H254 2564 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 GREB1Q4ZG55 1949 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 FAM170BA6NMN3 283 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 KRT19P08727 400 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM191BP0C7N4 346 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 PSMC3P17980 439 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 GDI1P31150 447 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 ME1P48163 572 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 FAM26FQ5R3K3 315 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 ITIH5Q86UX2 942 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 C1orf210Q8IVY1 113 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 PDCL2Q8N4E4 241 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-212ENST00000567828 DNASE1L2Q92874 299 aa24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms