RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 NPAS3Q8IXF0 933 aa18.41■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC44A3Q8N4M1 653 aa18.41■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 ITFG1Q8TB96 612 aa18.41■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 FNBP1Q96RU3 617 aa18.41■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRRX2Q99811 253 aa18.41■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 CORO1BQ9BR76 489 aa18.41■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa18.41■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASB3Q9Y575 518 aa18.41■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP34Q70CQ2 3546 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 HUS1O60921 280 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT19P08727 400 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRFP11831 508 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALDH1A3P47895 512 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 TUFMP49411 452 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 EPHA5P54756 1037 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP24A1Q07973 514 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 WSCD1Q658N2 575 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 DPH6Q7L8W6 267 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC9A9Q8IVB4 645 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 TOP6BLQ8N6T0 577 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA0895Q8NCT3 520 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRSS33Q8NF86 280 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR10T2Q8NGX3 314 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 PGLYRP2Q96PD5 576 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASAH2Q9NR71 780 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 WNT16Q9UBV4 365 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 SIX4Q9UIU6 781 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUMBLQ9Y6R0 609 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 DOCK6Q96HP0 2047 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 NOTCH4Q99466 2003 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDXKO00764 312 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLIC2O15247 247 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 RHOBTB3O94955 611 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF202O95125 648 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 VNN2O95498 520 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUBP1P53384 320 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPN5P54829 565 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSPY1Q01534 308 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 BFSP1Q12934 665 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 DUSP4Q13115 394 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC39A12Q504Y0 691 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRSS36Q5K4E3 855 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDCL2Q8N4E4 241 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR5B17Q8NGF7 314 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPPL2BQ8TCT7 592 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 RSAD2Q8WXG1 361 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 CGRRF1Q99675 332 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 RTP3Q9BQQ7 232 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMOC2Q9H3U7 446 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 GDPD2Q9HCC8 539 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP72Q9P209 647 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXL21Q9UKT6 434 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPRJQ12913 1337 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 EXOC3O60645 756 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 FGF19O95750 216 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNNI1P19237 187 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 LHX1P48742 406 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYL7Q01449 175 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 DPYDQ12882 1025 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNB1Q14721 858 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC5A9Q2M3M2 681 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 IER5LQ5T953 404 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ITIH5Q86UX2 942 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 RDH13Q8NBN7 331 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATAD1Q8NBU5 361 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 HPDLQ96IR7 371 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM209Q96SK2 561 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACBD6Q9BR61 282 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCTD10Q9H3F6 313 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 MFSD1Q9H3U5 465 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 DMAC2Q9NW81 257 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 L1RE1Q9UN81 338 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNX9Q9Y5X1 595 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ECI2O75521 394 aa18.37■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 DLATP10515 647 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 AP3M2P53677 418 aa18.37■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 VEPH1Q14D04 833 aa18.37■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PARM1Q6UWI2 310 aa18.37■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa18.37■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ING5Q8WYH8 240 aa18.37■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 FGF14Q92915 247 aa18.37■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSMG2Q969U7 264 aa18.37■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHOX2BQ99453 314 aa18.37■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPR88Q9GZN0 384 aa18.37■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRISPLD1Q9H336 500 aa18.37■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 NARSO43776 548 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEBPBP17676 345 aa18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCSK1P29120 753 aa18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 AVPR2P30518 371 aa18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLCN5P51795 746 aa18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 LIMS2Q7Z4I7 341 aa18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 KMT2EQ8IZD2 1858 aa18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADGRF2Q8IZF7 708 aa18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms