RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	ENPEP	Q07075	957 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	HYAL1	Q12794	435 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF280D	Q6N043	979 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	GJB7	Q6PEY0	223 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	APPL2	Q8NEU8	664 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	KAT5	Q92993	513 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	ARID3A	Q99856	593 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	NDST4	Q9H3R1	872 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	MTRR	Q9UBK8	725 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	NME7	Q9Y5B8	376 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	SZT2	Q5T011	3432 aa		9.11	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744		H7C4K7	107 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	ATP2C2	O75185	946 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	CYP11A1	P05108	521 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	TPM2	P07951	284 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	CPB1	P15086	417 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	TYMP	P19971	482 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	LMO2	P25791	158 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	OR1D2	P34982	312 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	ASPA	P45381	313 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	TPM4	P67936	248 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	DUSP6	Q16828	381 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	WDR44	Q5JSH3	913 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	RRAGA	Q7L523	313 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	LMO3	Q8TAP4	145 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	NT5C1B	Q96P26	610 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	APOL5	Q9BWW9	433 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	SNX25	Q9H3E2	840 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	WDR27	A2RRH5	827 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	LGALS16	A8MUM7	142 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	OAZ2	O95190	189 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	CALCA	P01258	141 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	ADH1A	P07327	375 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	P4HA1	P13674	534 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	NDUFV1	P49821	464 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	ROR1	Q01973	937 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	KCNMA1	Q12791	1236 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	CETN1	Q12798	172 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	CLUL1	Q15846	466 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF394	Q53GI3	561 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	GBP6	Q6ZN66	633 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	TAF4B	Q92750	862 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RPL4-208	ENST00000564744	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95

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