RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	FLCN	Q8NFG4	579 aa		23.48	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA32	Q96LK8	384 aa		23.48	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		23.48	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		23.48	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		23.48	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF233	A6NK53	670 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	PI15	O43692	258 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	KLRC4	O43908	158 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	PFKFB1	P16118	471 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT85	P78386	507 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	PLD1	Q13393	1074 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL23	Q86XA0	190 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	PAGE5	Q96GU1	130 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	KXD1	Q9BQD3	176 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	INTS13	Q9NVM9	706 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	23.46	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		23.46	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GVL5	298 aa		23.46	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	23.46	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ECI2	O75521	394 aa		23.46	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	FCAR	P24071	287 aa		23.46	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TMC8	Q8IU68	726 aa		23.46	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		23.46	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		23.46	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		23.46	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		23.46	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ASAH2	Q9NR71	780 aa		23.46	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CA14	Q9ULX7	337 aa		23.46	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	23.45	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	L1RE1	Q9UN81	338 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	EPHB3	P54753	998 aa		23.44	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	RBP5	P82980	135 aa		23.44	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SURF1	Q15526	300 aa		23.44	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	23.44	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		23.44	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		23.44	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		23.44	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		23.44	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	USP25	Q9UHP3	1055 aa		23.44	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ASB3	Q9Y575	518 aa		23.44	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	23.44	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	CLIC2	O15247	247 aa		23.43	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SOAT2	O75908	522 aa		23.43	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		23.43	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	MYL4	P12829	197 aa		23.43	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ALDH1A3	P47895	512 aa		23.43	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	STK4	Q13043	487 aa		23.43	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		23.43	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR49	Q8IV35	697 aa		23.43	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		23.43	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	23.43	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMG2	Q969U7	264 aa		23.43	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ASB16	Q96NS5	453 aa		23.43	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		23.43	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	23.43	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	F5	P12259	2224 aa		23.43	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT19	P08727	400 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	GJA1	P17302	382 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SMARCB1	Q12824	385 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	HUS1	O60921	280 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	MYL1	P05976	194 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ATF6	P18850	670 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP2J2	P51589	502 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFA8	P51970	172 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	STARD6	P59095	220 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	BFSP1	Q12934	665 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA18	Q8TC71	538 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		23.42	■■□□□ 1.34

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