RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 FGBP02675 491 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 ABCD1P33897 745 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 RAB27AP51159 221 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 CLCNKBP51801 687 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 FOXK2Q01167 660 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 GOLGA8FQ08AF8 430 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 IKBKEQ14164 716 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 NR1I3Q14994 352 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 MAN2A1Q16706 1144 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC40Q4G0X9 1142 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 VWA3BQ502W6 1294 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 SARM1Q6SZW1 724 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 HASPINQ8TF76 798 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 C1orf112Q9NSG2 853 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 POLIQ9UNA4 740 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 EPOPA6NHQ4 379 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 PIRO00625 290 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 BAIAP3O94812 1187 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 KIF4AO95239 1232 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 EOMESO95936 686 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 HLA-DRAP01903 254 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 ITGB3P05106 788 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 RPL13P26373 211 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 GPC1P35052 558 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 SLC11A1P49279 550 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 MYL6P60660 151 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 PKDCCQ504Y2 493 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 C9orf57Q5W0N0 161 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 CREBRFQ8IUR6 639 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 WDR49Q8IV35 697 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 UBR7Q8N806 425 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 B3GALT6Q96L58 329 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 TTYH3Q9C0H2 523 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 GPR88Q9GZN0 384 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 GANQ9H2C0 597 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 NDST4Q9H3R1 872 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 HMGXB4Q9UGU5 601 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 COQ4Q9Y3A0 265 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 C2CD2Q9Y426 696 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 BECN2A8MW95 431 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 SPINT1O43278 529 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 IL18RAPO95256 599 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 CAVIN2O95810 425 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 LDHAP00338 332 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 AFPP02771 609 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 PFKMP08237 780 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 TNNI1P19237 187 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 PON1P27169 355 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 BRCC3P46736 316 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 RAP1GAPP47736 663 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 MXI1P50539 228 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF75DP51815 510 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 CDR1P51861 262 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 MYL7Q01449 175 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 GRIK3Q13003 919 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 SYCP1Q15431 976 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 UPP1Q16831 310 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 TRIM65Q6PJ69 517 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 TAS1R1Q7RTX1 841 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 OSTM1Q86WC4 334 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-211ENST00000561438 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms