RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-211ENST00000559850 YIPF1Q9Y548 306 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-211ENST00000559850 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-211ENST00000559850 CALUO43852 315 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-211ENST00000559850 PAX3P23760 479 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-211ENST00000559850 GPR17Q13304 367 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-211ENST00000559850 MYBPC2Q14324 1141 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-211ENST00000559850 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-211ENST00000559850 THEM5Q8N1Q8 247 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-211ENST00000559850 PLCD3Q8N3E9 789 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-211ENST00000559850 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-211ENST00000559850 TMLHEQ9NVH6 421 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-211ENST00000559850 CEP72Q9P209 647 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-211ENST00000559850 DSEQ9UL01 958 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-211ENST00000559850 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-211ENST00000559850 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-211ENST00000559850 TECTAO75443 2155 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 HUS1O60921 280 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 RHOP08100 348 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 CENPPQ6IPU0 288 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 POTEHQ6S545 545 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 TCEAL4Q96EI5 215 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 EEF2KMTQ96G04 330 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 CCDC34Q96HJ3 373 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 KCNK12Q9HB15 430 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 NARSO43776 548 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 KINO60870 393 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 GPR37L1O60883 481 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 PHACTR2O75167 634 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 CLSTN1O94985 981 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 MYL4P12829 197 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 LAMP2P13473 410 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 GJA1P17302 382 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 CEBPBP17676 345 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 PTPN2P17706 415 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 NR2F2P24468 414 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 CCR2P41597 374 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 PRCPP42785 496 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 MYL6P60660 151 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 MYO1EQ12965 1108 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 BIRC3Q13489 604 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 SOWAHAQ2M3V2 549 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 TRIM67Q6ZTA4 783 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 ADGRF2Q8IZF7 708 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 FGF13Q92913 245 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 SMARCE1Q969G3 411 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 TIGD1Q96MW7 591 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 DNAJC25Q9H1X3 360 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 RMND1Q9NWS8 449 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 GDAP2Q9NXN4 497 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 EPS15L1Q9UBC2 864 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 SORCS3Q9UPU3 1222 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 TMEM221A6NGB7 291 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 M0R296 226 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 ATP2C2O75185 946 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 AKAP3O75969 853 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 KIF20AO95235 890 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 SMC2O95347 1197 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 POU2F2P09086 479 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 TRIM49P0CI25 452 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 TRIM49CP0CI26 452 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 TRPC3Q13507 836 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 MTMR3Q13615 1198 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 ZCWPW2Q504Y3 356 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 PRSS36Q5K4E3 855 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 C1orf220Q5T0J3 134 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 HFE2Q6ZVN8 426 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 NPAS3Q8IXF0 933 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 TOP6BLQ8N6T0 577 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 STKLD1Q8NE28 680 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 GPR152Q8TDT2 470 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 MCRS1Q96EZ8 462 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 MMS19Q96T76 1030 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 LPIN3Q9BQK8 851 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 MMRN2Q9H8L6 949 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 MAN1B1Q9UKM7 699 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 CDH7Q9ULB5 785 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 NME7Q9Y5B8 376 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 VNN1O95497 513 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-211ENST00000559850 LMO2P25791 158 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms