RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556007.6

TIMM9-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 3 BASIC

Gene TIMM9, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-208	ENST00000556007	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	PROK1	P58294	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	PBK	Q96KB5	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007		A0A0B4J269	797 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	DTNB	O60941	627 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	POU2F2	P09086	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	RARB	P10826	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	CCND1	P24385	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	NOG	Q13253	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	TUBB3	Q13509	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	USP45	Q70EL2	814 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	LINC00473	A8K010	186 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	TRIAP1	O43715	76 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	CHRM2	P08172	466 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	CDK4	P11802	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	GPD1	P21695	349 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	NDUFV1	P49821	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	RFK	Q969G6	155 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	RGMA	Q96B86	450 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007		F5H697	171 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-208	ENST00000556007	AOX1	Q06278	1338 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	TYR	P14679	529 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	AKAP5	P24588	427 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	LMO1	P25800	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	USP37	Q86T82	979 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	NELL2	Q99435	816 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	VCAM1	P19320	739 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	ITGAL	P20701	1170 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	MAP2K6	P52564	334 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TIMM9-208	ENST00000556007	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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