RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 MARCH6O60337 910 aa7.41□□□□□ -1.22
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CTDSP2-208ENST00000552294 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 OAZ2O95190 189 aa7.41□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CXCL8P10145 99 aa7.41□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 MCM4P33991 863 aa7.41□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 MCM7P33993 719 aa7.41□□□□□ -1.22
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CTDSP2-208ENST00000552294 GALNT17Q6IS24 598 aa7.41□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 PDXDC1Q6P996 788 aa7.41□□□□□ -1.22
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CTDSP2-208ENST00000552294 LINC00597Q9H2U6 94 aa7.41□□□□□ -1.22
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CTDSP2-208ENST00000552294 CAVIN2O95810 425 aa7.4□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CCDC192P0DO97 292 aa7.4□□□□□ -1.22
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CTDSP2-208ENST00000552294 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 PLD1Q13393 1074 aa7.4□□□□□ -1.22
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CTDSP2-208ENST00000552294 UAP1L1Q3KQV9 507 aa7.4□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa7.4□□□□□ -1.22
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CTDSP2-208ENST00000552294 IQCEQ6IPM2 695 aa7.4□□□□□ -1.22
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CTDSP2-208ENST00000552294 RTL10Q7L3V2 364 aa7.4□□□□□ -1.22
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CTDSP2-208ENST00000552294 UROC1Q96N76 676 aa7.4□□□□□ -1.22
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CTDSP2-208ENST00000552294 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.4□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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CTDSP2-208ENST00000552294 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.4□□□□□ -1.22
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CTDSP2-208ENST00000552294 STK36Q9NRP7 1315 aa7.39□□□□□ -1.23
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CTDSP2-208ENST00000552294 HIP1RO75146 1068 aa7.39□□□□□ -1.23
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CTDSP2-208ENST00000552294 GPR17Q13304 367 aa7.39□□□□□ -1.23
CTDSP2-208ENST00000552294 RUNX3Q13761 415 aa7.39□□□□□ -1.23
CTDSP2-208ENST00000552294 DMC1Q14565 340 aa7.39□□□□□ -1.23
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CTDSP2-208ENST00000552294 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.39□□□□□ -1.23
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF280DQ6N043 979 aa7.39□□□□□ -1.23
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC39A4Q6P5W5 647 aa7.39□□□□□ -1.23
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