RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	TWF1	Q12792	350 aa		15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	CCIN	Q13939	588 aa		15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	LRRC32	Q14392	662 aa		15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	MCM6	Q14566	821 aa		15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	PLK5	Q496M5	336 aa		15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	HACE1	Q8IYU2	909 aa		15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	DEFB124	Q8NES8	71 aa		15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	HHIP	Q96QV1	700 aa		15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	KCND2	Q9NZV8	630 aa		15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	EML5	Q05BV3	1969 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222		A0A1B0GVL5	298 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PRU2	124 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	LNP1	A1A4G5	178 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	ANTXRL	A6NF34	631 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	PFKFB1	P16118	471 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	GUCY2C	P25092	1073 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	ELF1	P32519	619 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	ARSH	Q5FYA8	562 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	IQUB	Q8NA54	791 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	CHFR	Q96EP1	664 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	CUEDC2	Q9H467	287 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		15.04	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	NDUFA8	P51970	172 aa		15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	TFDP1	Q14186	410 aa		15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	GPBP1	Q86WP2	473 aa		15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	FSIP1	Q8NA03	581 aa		15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	BSND	Q8WZ55	320 aa		15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	DHX58	Q96C10	678 aa		15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	VPS45	Q9NRW7	570 aa		15.03	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	VNN2	O95498	520 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	OR4Q2	P0C623	313 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	ATF2	P15336	505 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	MAPK7	Q13164	816 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	UPP1	Q16831	310 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	SV2B	Q7L1I2	683 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	YAF2	Q8IY57	180 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	DAW1	Q8N136	415 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	CEP120	Q8N960	986 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	KIFAP3	Q92845	792 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	LOXL4	Q96JB6	756 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	LRRC3	Q9BY71	257 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		15.02	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	15.02	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	ZNF197	O14709	1029 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	CHAD	O15335	359 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	HIP1R	O75146	1068 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	SOAT2	O75908	522 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	CAVIN2	O95810	425 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	SLFN14	P0C7P3	912 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	HOXA6	P31267	233 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	SYK	P43405	635 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	POU5F1B	Q06416	359 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	PDXDC1	Q6P996	788 aa		15.01	□□□□□ -0.01

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