RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551327.5

PXN-218, Transcript of paxillin, humanhuman

TSL 4

Gene PXN, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXN-218ENST00000551327 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 CCL16O15467 120 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ZZEF1O43149 2961 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 EXTL3O43909 919 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 LRG1P02750 347 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ODC1P11926 461 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 MCM4P33991 863 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 BRCC3P46736 316 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 OSTNP61366 133 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 TMEM132DQ14C87 1099 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 BMT2Q1RMZ1 405 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 CYP4A22Q5TCH4 519 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 IQCEQ6IPM2 695 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 BRSK2Q8IWQ3 736 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ELMOD1Q8N336 334 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 PJA1Q8NG27 643 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 HINFPQ9BQA5 517 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 TRIM9Q9C026 710 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ABCB6Q9NP58 842 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 PARD6AQ9NPB6 346 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ITGA11Q9UKX5 1188 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 INSL5Q9Y5Q6 135 aa9.51□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 RHOP08100 348 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 PFKLP17858 780 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 NMT1P30419 496 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 TNFSF9P41273 254 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 RPS9P46781 194 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 TAF6P49848 677 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 PSMD2Q13200 908 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 STK38Q15208 465 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 LPAL2Q16609 132 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 SLC5A9Q2M3M2 681 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 SV2CQ496J9 727 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 OVOS1Q6IE37 1185 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 CENPPQ6IPU0 288 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ARMCX5Q6P1M9 558 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 USP37Q86T82 979 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ITIH5Q86UX2 942 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 SFR1Q86XK3 245 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 HSCBQ8IWL3 235 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 THEM5Q8N1Q8 247 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 CXorf38Q8TB03 319 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 GOLGA5Q8TBA6 731 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 SPPL2BQ8TCT7 592 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 POMGNT1Q8WZA1 660 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 SENP8Q96LD8 212 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ZNF560Q96MR9 790 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 PLIN2Q99541 437 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ACBD6Q9BR61 282 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 LRRC3Q9BY71 257 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 PANK4Q9NVE7 773 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.5□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 KPNA7A9QM74 516 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ANKRD63C9JTQ0 380 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 I3L4J1 428 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 PRRG1O14668 218 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 F13A1P00488 732 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 RFX1P22670 979 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 TGM1P22735 817 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 AP3M2P53677 418 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 CLDN10P78369 228 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 FOXK2Q01167 660 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 WDR44Q5JSH3 913 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 RESP18Q5W5W9 173 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 JADE1Q6IE81 842 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 UNC13DQ70J99 1090 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 PSMG2Q969U7 264 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 CLDN23Q96B33 292 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 CLIC6Q96NY7 704 aa9.49□□□□□ -0.89
PXN-218ENST00000551327 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms