RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 ZFP42Q96MM3 310 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 RBBP8Q99708 897 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF577Q9BSK1 485 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 UBXN6Q9BZV1 441 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 EFCAB1Q9HAE3 211 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 TUFT1Q9NNX1 390 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 PFASO15067 1338 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 SSNA1O43805 119 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 FEN1P39748 380 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 USP4Q13107 963 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 SULT1C3Q6IMI6 304 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 RAD9BQ6WBX8 426 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 DEFB107AQ8IZN7 70 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 PGBD4Q96DM1 585 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 GGA2Q9UJY4 613 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF221Q9UK13 617 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 GRID1Q9ULK0 1009 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 TRPC5OSA6NMA1 111 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 PDK3Q15120 406 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 KIZQ2M2Z5 673 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 ZFP69Q49AA0 526 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC157Q569K6 752 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 ERICH5Q6P6B1 374 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 FBXO11Q86XK2 927 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 GGA1Q9UJY5 639 aa8.99□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 NOTOA8MTQ0 251 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 APOL1O14791 398 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 CHRNB3Q05901 458 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 SPICE1Q8N0Z3 855 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF285Q96NJ3 590 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 ERP44Q9BS26 406 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 KCNQ4P56696 695 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 BNC1Q01954 994 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 TTC27Q6P3X3 843 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 S100ZQ8WXG8 99 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 STAP2Q9UGK3 403 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 L1RE1Q9UN81 338 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 AREL1O15033 823 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 CCR3P51677 355 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 TNFAIP2Q03169 654 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 C1DQ13901 141 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 BORCS5Q969J3 196 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 CLOCKO15516 846 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 FCGR1AP12314 374 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 PURAQ00577 322 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 C5orf22Q49AR2 442 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 SAPCD2Q86UD0 394 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 PICK1Q9NRD5 415 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 DMTF1Q9Y222 760 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 SEC24AO95486 1093 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 AQP5P55064 265 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 TC2NQ8N9U0 490 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 ING3Q9NXR8 418 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 A0A1B0GTH6 734 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 ADAMTS2O95450 1211 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 CENPAP49450 140 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 TCP10Q12799 353 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF394Q53GI3 561 aa8.98□□□□□ -0.97
ATXN3-216ENST00000545170 C2CD6Q53TS8 623 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms