RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 C19orf81C9J6K1 198 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 TAF4O00268 1085 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MATN2O00339 956 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MSH4O15457 936 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ACTN1P12814 892 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ABCB4P21439 1286 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CALB2P22676 271 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 C6orf183Q5T699 404 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 TTC30AQ86WT1 665 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 AGAP11Q8TF27 550 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 WDR18Q9BV38 432 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 PPME1Q9Y570 386 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CNTNAP1P78357 1384 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 FAM25AB3EWG3 89 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 FAM25CB3EWG5 89 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 FAM25GB3EWG6 89 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 FCER1AP12319 257 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 ERVK-24P63145 666 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 KRT76Q01546 638 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 DYMQ7RTS9 669 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 RAPGEF5Q92565 580 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 C8orf4Q9NR00 106 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 CES2O00748 559 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 CAVIN3Q969G5 261 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CCT7Q99832 543 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 RNF220Q5VTB9 566 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 INPP5DQ92835 1189 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 LENG9Q96B70 501 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 ITPKCQ96DU7 683 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 EPAS1Q99814 870 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CDKL2Q92772 493 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.35□□□□□ -1.39
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