RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 EBF3Q9H4W6 596 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 KIAA1257Q9ULG3 409 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 LZTS1Q9Y250 596 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 AP4S1Q9Y587 144 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ACEP12821 1306 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 MYH1P12882 1939 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 A0A1B0GUL6 1792 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC160A6NGH7 325 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 FAM47DPA6NHR8 397 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SNTNA6NMZ2 147 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF839A8K0R7 811 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 E7EWF7 191 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 KRIT1O00522 736 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 FOXN1O15353 648 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 YKT6O15498 198 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 KCNQ3O43525 872 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ICMTO60725 284 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 KCNJ13O60928 360 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ITGB3P05106 788 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 WEE1P30291 646 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 IFNA8P32881 189 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 MAPKAPK2P49137 400 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 RAD51Q06609 339 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 PPP2R5CQ13362 524 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 PRKG1Q13976 671 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SQLEQ14534 574 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SLC18A3Q16572 532 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 DGKDQ16760 1214 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF827Q17R98 1081 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 PROSER3Q2NL68 480 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 GPR141Q7Z602 305 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 PALB2Q86YC2 1186 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 EXD1Q8NHP7 514 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SLCO2A1Q92959 643 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 HES6Q96HZ4 224 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CIB1Q99828 191 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 GON7Q9BXV9 100 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 HIPK3Q9H422 1215 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 RMND5AQ9H871 391 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 STMN3Q9NZ72 180 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 RPTORQ8N122 1335 aa6.44□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 MYH6P13533 1939 aa6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 MYH2Q9UKX2 1941 aa6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ARID3CA6NKF2 412 aa6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SMIM23A6NLE4 172 aa6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 F6X3S4 739 aa6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SHOXO15266 292 aa6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 LGR5O75473 907 aa6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 GMNNO75496 209 aa6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 PALMO75781 387 aa6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 RHOBTB3O94955 611 aa6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CAMTA2O94983 1202 aa6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 OR6B1O95007 311 aa6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 MMP1P03956 469 aa6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.43□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 BRAFP15056 766 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms