RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 MOSPD3O75425 235 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 PRKCQQ04759 706 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 TEAD2Q15562 447 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 TTC9BQ8N6N2 239 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 C1orf127Q8N9H9 656 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 FAM200AQ8TCP9 573 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 SMARCD2Q92925 531 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 C7orf25Q9BPX7 421 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 PDE11AQ9HCR9 933 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 A0A1W2PRU2 124 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 KRT19P08727 400 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 TMEM191BP0C7N4 346 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 FCARP24071 287 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 TUFMP49411 452 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 GRM2Q14416 872 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 MGAT5BQ3V5L5 792 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 FAM26FQ5R3K3 315 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 PJA1Q8NG27 643 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 SHKBP1Q8TBC3 707 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 BLZF1Q9H2G9 400 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 MAGEF1Q9HAY2 307 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 HSFX1Q9UBD0 423 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 ASB3Q9Y575 518 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-206ENST00000534219 NOTCH4Q99466 2003 aa26.89■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 KANSL1LA0AUZ9 987 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF233A6NK53 670 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 BFSP1Q12934 665 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 UBXN2BQ14CS0 331 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 ITIH5Q86UX2 942 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 TMC8Q8IU68 726 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 FAM84AQ96KN4 292 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 GPR88Q9GZN0 384 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 BRD9Q9H8M2 597 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 ITGA11Q9UKX5 1188 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 GFRA3O60609 400 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 HUS1O60921 280 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 CASP1P29466 404 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 VIPR2P41587 438 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 RESP18Q5W5W9 173 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 CNNM4Q6P4Q7 775 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 UNC13DQ70J99 1090 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 PSMG2Q969U7 264 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 LRRC3Q9BY71 257 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 MTMR12Q9C0I1 747 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 HSPBP1Q9NZL4 362 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 LRRN2O75325 713 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 CD72P21854 359 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 HOXD13P35453 343 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 NBL1P41271 181 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 AFMP43652 599 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 RBP5P82980 135 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 SMARCB1Q12824 385 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 VEPH1Q14D04 833 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 TPRG1Q6ZUI0 275 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 LRRTM3Q86VH5 581 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 CBWD2Q8IUF1 395 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 PDCL2Q8N4E4 241 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 LRRC52Q8N7C0 313 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF507Q8TCN5 953 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 LPIN3Q9BQK8 851 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 ATXN3LQ9H3M9 355 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 HEBP1Q9NRV9 189 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 FAM170BA6NMN3 283 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 PSMC3P17980 439 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 TSPY1Q01534 308 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 TAF12Q16514 161 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 SCARA3Q6AZY7 606 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 VITQ6UXI7 678 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 FRMD5Q7Z6J6 570 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 NELFCDQ8IXH7 590 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 CEP57L1Q8IYX8 460 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 SPPL2BQ8TCT7 592 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 KIAA1586Q9HCI6 787 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 L1RE1Q9UN81 338 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 SNX9Q9Y5X1 595 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 PROB1E7EW31 1015 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 FGF19O95750 216 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 TNNC2P02585 160 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 GABRR2P28476 465 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 GDI1P31150 447 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 SURF1Q15526 300 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-206ENST00000534219 RDH13Q8NBN7 331 aa26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms