RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 FSHRP23945 695 aa20.08■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 STIM1Q13586 685 aa20.08■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 HTR4Q13639 388 aa20.08■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 TMEM132DQ14C87 1099 aa20.08■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 ANGPT1Q15389 498 aa20.08■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.08■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.08■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 GPR65Q8IYL9 337 aa20.08■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 MLKLQ8NB16 471 aa20.08■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.08■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 UROC1Q96N76 676 aa20.08■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 TBC1D17Q9HA65 648 aa20.08■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 POLIQ9UNA4 740 aa20.08■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.08■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 NOTCH4Q99466 2003 aa20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 ANO9A1A5B4 782 aa20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 PAPLNO95428 1278 aa20.07■□□□□ 0.8
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PUF60-218ENST00000531995 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 STX17P56962 302 aa20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 DLG4P78352 724 aa20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 CLDN10P78369 228 aa20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 LRRC63Q05C16 580 aa20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 CEP135Q66GS9 1140 aa20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
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PUF60-218ENST00000531995 DTWD2Q8NBA8 298 aa20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 WNT16Q9UBV4 365 aa20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 DCHS1Q96JQ0 3298 aa20.07■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 I3L4J1 428 aa20.06■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 PODXLO00592 558 aa20.06■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 PIRO00625 290 aa20.06■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 MAPK13O15264 365 aa20.06■□□□□ 0.8
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PUF60-218ENST00000531995 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.06■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.06■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 BEST2Q8NFU1 509 aa20.06■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.06■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 INTS13Q9NVM9 706 aa20.06■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 DPP3Q9NY33 737 aa20.06■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
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PUF60-218ENST00000531995 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa20.06■□□□□ 0.8
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PUF60-218ENST00000531995 B3GAT3O94766 335 aa20.05■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 C1RP00736 705 aa20.05■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 PTMSP20962 102 aa20.05■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
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PUF60-218ENST00000531995 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.05■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 FGF14Q92915 247 aa20.05■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 TSG101Q99816 390 aa20.05■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.05■□□□□ 0.8
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PUF60-218ENST00000531995 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.05■□□□□ 0.8
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PUF60-218ENST00000531995 OR1D2P34982 312 aa20.04■□□□□ 0.8
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PUF60-218ENST00000531995 WDR49Q8IV35 697 aa20.04■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.04■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 TMC2Q8TDI7 906 aa20.04■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 CGRRF1Q99675 332 aa20.04■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.04■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.04■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.04■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 SPTLC1O15269 473 aa20.03■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 DCNP07585 359 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
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PUF60-218ENST00000531995 FGFR3P22607 806 aa20.03■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.03■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.03■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 ITFG1Q8TB96 612 aa20.03■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 ING5Q8WYH8 240 aa20.03■□□□□ 0.8
PUF60-218ENST00000531995 FGF13Q92913 245 aa20.03■□□□□ 0.8
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