RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520837.5

TSPAN18-208, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN18, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-208ENST00000520837 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.97□□□□□ -0.81
TSPAN18-208ENST00000520837 NLRC4Q9NPP4 1024 aa9.97□□□□□ -0.81
TSPAN18-208ENST00000520837 ABHD10Q9NUJ1 306 aa9.97□□□□□ -0.81
TSPAN18-208ENST00000520837 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.97□□□□□ -0.81
TSPAN18-208ENST00000520837 COG5Q9UP83 839 aa9.97□□□□□ -0.81
TSPAN18-208ENST00000520837 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TSPAN18-208ENST00000520837 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.97□□□□□ -0.81
TSPAN18-208ENST00000520837 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 F8W810 466 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 C2CD2LO14523 706 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 LINC01565O15544 149 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 ARHGAP6O43182 974 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 IL18RAPO95256 599 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 CXCL14O95715 111 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 TNNC2P02585 160 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 THP07101 528 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 AP3M2P53677 418 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 CCZ1BP86790 482 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 KCNMA1Q12791 1236 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 GRIK3Q13003 919 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 ASIC2Q16515 512 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 CBWD6Q4V339 395 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 CBWD3Q5JTY5 395 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 CBWD5Q5RIA9 395 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 BRSK2Q8IWQ3 736 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 COLGALT2Q8IYK4 626 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 HASPINQ8TF76 798 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 ACAP3Q96P50 834 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 DNAJC7Q99615 494 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 TMEM175Q9BSA9 504 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 CXCL16Q9H2A7 254 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 LZTS1Q9Y250 596 aa9.96□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 SOWAHDA6NJG2 315 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 HIDE1A8MVS5 230 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 PTGESO14684 152 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 ZSCAN12O43309 604 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 MAP3K7O43318 606 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 CCDC172P0C7W6 258 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 UCHL3P15374 230 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 PROZP22891 400 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 GRM5P41594 1212 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 PIK3CAP42336 1068 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 ARID5AQ03989 594 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 TUSC3Q13454 348 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 TRPC3Q13507 836 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 KIAA1841Q6NSI8 718 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 PDXDC1Q6P996 788 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 TRIM65Q6PJ69 517 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 SV2AQ7L0J3 742 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 FBXL13Q8NEE6 735 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 PLEKHO2Q8TD55 490 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 NT5C1BQ96P26 610 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 CGRRF1Q99675 332 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 DEF6Q9H4E7 631 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.822e-15■■■■■ 372.6
TSPAN18-208ENST00000520837 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa9.95□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 LRRC53A6NM62 1247 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 FSCN2O14926 492 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 EPHB6O15197 1021 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 PMM2O15305 246 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 NCK2O43639 380 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 TADA2AO75478 443 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 NOL4O94818 638 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 URODP06132 367 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 TMEM191BP0C7N4 346 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 CXCL8P10145 99 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 USP8P40818 1118 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 TNFSF9P41273 254 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 STAT1P42224 750 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 MFAP3P55082 362 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 RBM10P98175 930 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 APBA1Q02410 837 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 DSC1Q08554 894 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 SPA17Q15506 151 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 C1orf220Q5T0J3 134 aa9.94□□□□□ -0.82
TSPAN18-208ENST00000520837 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms