RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516743.1

RNU6-307P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 307, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-307P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-307P-201ENST00000516743 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 SP2Q02086 613 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 FPGSQ05932 587 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 ZNF844Q08AG5 666 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 GADL1Q6ZQY3 521 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 USP45Q70EL2 814 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 PSD4Q8NDX1 1056 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 ZNF384Q8TF68 577 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 SNX19Q92543 992 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 TCF7L1Q9HCS4 588 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 RLIMQ9NVW2 624 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 SLC17A6Q9P2U8 582 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 TOR1BO14657 336 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 ZNF213O14771 459 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 PDHA1P08559 390 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 TYRP14679 529 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 CHRM3P20309 590 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 CD38P28907 300 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 CYP2C19P33261 490 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 PIK3CGP48736 1102 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 ATP2B3Q16720 1220 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 NBPF8Q3BBV2 869 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 SLC30A10Q6XR72 485 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 C1QL2Q7Z5L3 287 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 C3orf20Q8ND61 904 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 RGMAQ96B86 450 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 REPS1Q96D71 796 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 OSBPL9Q96SU4 736 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 KIAA1586Q9HCI6 787 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 DMTF1Q9Y222 760 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 NEU2Q9Y3R4 380 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 ABLIM3O94929 683 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 LATS1O95835 1130 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 C1RP00736 705 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 ALDH2P05091 517 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 FTH1P19P0C7X4 201 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 RARBP10826 455 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 HDCP19113 662 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 NDUFV1P49821 464 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 KAZNQ674X7 775 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 PPP4R3AQ6IN85 833 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 FBXL20Q96IG2 436 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 PGBD1Q96JS3 809 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 PBKQ96KB5 322 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 BRD9Q9H8M2 597 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 KLC4Q9NSK0 619 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 ABCF2Q9UG63 623 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 MRFAP1Q9Y605 127 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 KAT6AQ92794 2004 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 A0A0B4J269 797 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 VPS4BO75351 444 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 DRD4P21917 467 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 PIGFQ07326 219 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 TUBB3Q13509 450 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 PLS1Q14651 629 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 ATAT1Q5SQI0 421 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 EMC10Q5UCC4 262 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 B3GNT9Q6UX72 402 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 MAVSQ7Z434 540 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 AMIGO2Q86SJ2 522 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 GLCCI1Q86VQ1 547 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 HPS3Q969F9 1004 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 CHMP4CQ96CF2 233 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 MRGPRX1Q96LB2 322 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 SMOQ99835 787 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 BRINP2Q9C0B6 783 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 SLAMF7Q9NQ25 335 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 CFAP97Q9P2B7 532 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 HESX1Q9UBX0 185 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 SPEF1Q9Y4P9 236 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-307P-201ENST00000516743 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-307P-201ENST00000516743 SLC16A6O15403 523 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-307P-201ENST00000516743 CHEK2O96017 543 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-307P-201ENST00000516743 FTLP02792 175 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-307P-201ENST00000516743 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms