RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIM43BA6NCK2 446 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 PMM2O15305 246 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 TBC1D4O60343 1298 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 ERN1O75460 977 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZFPL1O95159 310 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 UNC5CO95185 931 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIF20AO95235 890 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 NDUFA10O95299 355 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 HLA-DOAP06340 250 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNA2P16389 499 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 LAG3P18627 525 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC11A2P49281 568 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 CXADRP78310 365 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 DGCR2P98153 550 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 RESTQ13127 1097 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 CTBP1Q13363 440 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 DYRK1AQ13627 763 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBE4AQ14139 1066 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYP2A13Q16696 494 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 FNDC7Q5VTL7 733 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 IL31Q6EBC2 164 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 FOXR2Q6PJQ5 311 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF783Q6ZMS7 281 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPRED1Q7Z699 444 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 SESTD1Q86VW0 696 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 MICU3Q86XE3 530 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIB1Q96RU8 372 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPR20Q99678 358 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMOQ99835 787 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADAM2Q99965 735 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 HEPHQ9BQS7 1158 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF287Q9HBT7 754 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 GALNT9Q9HCQ5 603 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 COL20A1Q9P218 1284 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM50BQ9Y247 325 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYRFQ9Y2G1 1151 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 NCANO14594 1321 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRAMEF10O60809 474 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPFIA4O75335 1185 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SOAT2O75908 522 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRPP07492 148 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYP2C9P11712 490 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 VIPR2P41587 438 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TM4SF4P48230 202 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 CASP5P51878 434 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 UCP3P55916 312 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF543Q08ER8 600 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SCAPQ12770 1279 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC13A2Q13183 592 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PICALMQ13492 652 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPDYE7PQ495Y7 208 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP4R4Q6NUP7 873 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TAPT1Q6NXT6 567 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TAF2Q6P1X5 1199 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLNKQ7Z7G1 428 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRGPREQ86SM8 312 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 DPP9Q86TI2 863 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARHGEF19Q8IW93 802 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM46DQ8NEK8 389 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 HAS1Q92839 578 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MESP1Q9BRJ9 268 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 APOL5Q9BWW9 433 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF181Q9P0P0 153 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 XPR1Q9UBH6 696 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 HESX1Q9UBX0 185 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PHTF1Q9UMS5 762 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDYLQ9Y232 598 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 F8W8V4 182 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 M0QYG6 137 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 DCLK1O15075 740 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms