RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 TIMP4Q99727 224 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 F5H697 171 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 PROP1O75360 226 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 MATN4O95460 622 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 PPP3CBP16298 524 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 PHKA1P46020 1223 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.342e-6■■■□□ 14.7
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 MAPK10P53779 464 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 C21orf58P58505 322 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 NHLH1Q02575 133 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 USP37Q86T82 979 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 TFAP2BQ92481 460 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 VOPP1Q96AW1 172 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 MVB12AQ96EY5 273 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 PNPOQ9NVS9 261 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 A0A0B4J269 797 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 WDR27A2RRH5 827 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 C1QL1O75973 258 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 GNAI2P04899 355 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ANAPC15P60006 121 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 TUBB3Q13509 450 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 HOOK2Q96ED9 719 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 KLK15Q9H2R5 256 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 KLC4Q9NSK0 619 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ADM5C9JUS6 153 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ALDH1L1O75891 902 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 C1RP00736 705 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 NDUFV1P49821 464 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ARHGEF25Q86VW2 580 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 HPS3Q969F9 1004 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 UROC1Q96N76 676 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 PCSK5Q92824 1860 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ABLIM3O94929 683 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 KIF20AO95235 890 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 SOX10P56693 466 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 TXNRD1Q16881 649 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 COLEC12Q5KU26 742 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF384Q8TF68 577 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 MAP3K14Q99558 947 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 RAD54BQ9Y620 910 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 E2F8A0AVK6 867 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 H3BUI4 141 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 CHRM2P08172 466 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 PF4V1P10720 104 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ITGALP20701 1170 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 IGBP1P78318 339 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 PLS1Q14651 629 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC157Q569K6 752 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 EMC10Q5UCC4 262 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 FBXO41Q8TF61 875 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 NELL2Q99435 816 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ALG8Q9BVK2 526 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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