RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.15□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.15□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.15□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 GGA2Q9UJY4 613 aa6.15□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.15□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.15□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa6.15□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 MYH8P13535 1937 aa6.15□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 A8MXQ7 604 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 RASGRF2O14827 1237 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 FAM200BP0CF97 657 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 MYBP10242 640 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ARP10275 920 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 SLC8A1P32418 973 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 PCK1P35558 622 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ARL2P36404 184 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ZBTB16Q05516 673 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 MAPRE2Q15555 327 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CNGA2Q16280 664 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 RDH13Q8NBN7 331 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 HPDLQ96IR7 371 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 FAR2Q96K12 515 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ST7Q9NRC1 585 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 DPP3Q9NY33 737 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 VPS18Q9P253 973 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 FAM86B1E9PN63 330 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 M0QYV0 167 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ATG7O95352 703 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CYP1A2P05177 515 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ABHD2P08910 425 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 FAM86B2P0C5J1 330 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 INPP5BP32019 993 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 MAPK9P45984 424 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ITGA9Q13797 1035 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 SPARCL1Q14515 664 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 MFSD10Q14728 455 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 GRIK4Q16099 956 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ZNF280DQ6N043 979 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 KLHL7Q8IXQ5 586 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CYTH2Q99418 400 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 DLEC1Q9Y238 1755 aa6.15□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 LRRD1A4D1F6 860 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CHUKO15111 745 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 PFKLP17858 780 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 TYMPP19971 482 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 PTPN7P35236 360 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 BCAR1P56945 870 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ATP11AP98196 1134 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 AMPD2Q01433 879 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 GUCY2DQ02846 1103 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 DEUP1Q05D60 604 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ZNF33AQ06730 810 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 PRKG1Q13976 671 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ZACNQ401N2 412 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 DCAF6Q58WW2 860 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ATRIPQ8WXE1 791 aa6.14□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.6 ms