RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CXorf38Q8TB03 319 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM209Q96SK2 561 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC3Q9BY71 257 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFP14Q9HCL3 533 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBE4BO95155 1302 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H0Y858 1186 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TGFB1I1O43294 461 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MOSPD3O75425 235 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYL4P12829 197 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CMA1P23946 247 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRE11P49959 708 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRKCQQ04759 706 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC39A12Q504Y0 691 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC44A4Q53GD3 710 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM78AQ5JUQ0 283 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TANGO2Q6ICL3 276 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITIH5Q86UX2 942 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC105Q8IYK2 499 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATA18Q8TC71 538 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPPL2BQ8TCT7 592 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSMG2Q969U7 264 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASB16Q96NS5 453 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KXD1Q9BQD3 176 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAJC25Q9H1X3 360 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BLZF1Q9H2G9 400 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBC1D17Q9HA65 648 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INTS13Q9NVM9 706 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GDAP2Q9NXN4 497 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSPBP1Q9NZL4 362 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZDHHC9Q9Y397 364 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HUS1O60921 280 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FGF19O95750 216 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM191BP0C7N4 346 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RFX1P22670 979 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AFMP43652 599 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRT85P78386 507 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CUL4BQ13620 913 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DUOXA2Q1HG44 320 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BMT2Q1RMZ1 405 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRTM3Q86VH5 581 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMC8Q8IU68 726 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CBWD2Q8IUF1 395 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM86AQ8N2M4 240 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DTWD2Q8NBA8 298 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCFD1Q8WVM8 642 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMARCD2Q92925 531 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRPV4Q9HBA0 871 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP25Q9UHP3 1055 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SERTAD1Q9UHV2 236 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIT1Q9Y3P8 196 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FCARP24071 287 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CASP1P29466 404 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DPH6Q7L8W6 267 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HS2ST1Q7LGA3 356 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDR49Q8IV35 697 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDCL2Q8N4E4 241 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TOP6BLQ8N6T0 577 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 E2F7Q96AV8 911 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATA32Q96LK8 384 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZSWIM3Q96MP5 696 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACBD6Q9BR61 282 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTMR12Q9C0I1 747 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIX4Q9UIU6 781 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNNC2P02585 160 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYL1P05976 194 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRT19P08727 400 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYO1EQ12965 1108 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSMD2Q13200 908 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TEAD2Q15562 447 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C12orf56Q8IXR9 622 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTC9BQ8N6N2 239 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XXYLT1Q8NBI6 393 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SHKBP1Q8TBC3 707 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAGE5Q96GU1 130 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHOX2BQ99453 314 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OSBPL6Q9BZF3 934 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC39A2Q9NP94 309 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 L1RE1Q9UN81 338 aa18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms