RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 RGL1Q9NZL6 768 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 LRFN1Q9P244 771 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ABCF2Q9UG63 623 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MADDQ8WXG6 1647 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 LGALS16A8MUM7 142 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 hCG_1984214I3L0E3 225 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 HRKO00198 91 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 AKR1B10O60218 316 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ZBED4O75132 1171 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM127O75204 238 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CYP7B1O75881 506 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CHEK2O96017 543 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 LRG1P02750 347 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 HPXP02790 462 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 DBHP09172 617 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TXNP10599 105 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CYP2C9P11712 490 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 GABRB3P28472 473 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SLC5A2P31639 672 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MAN2A2P49641 1150 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ACTR2P61160 394 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ATP8B2P98198 1209 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MAPK7Q13164 816 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ADGRF1Q5T601 910 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM200BQ69YZ2 307 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 BICRALQ6AI39 1079 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 VASNQ6EMK4 673 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 RHOT1Q8IXI2 618 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 FAM9BQ8IZU0 186 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 AOPEPQ8N6M6 819 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 IL17RDQ8NFM7 739 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 OR2I1PQ8NGU4 316 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SGPP1Q9BX95 441 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PREBQ9HCU5 417 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TMLHEQ9NVH6 421 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CFAP97Q9P2B7 532 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 NFU1Q9UMS0 254 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 KAT6BQ8WYB5 2073 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ITSN2Q9NZM3 1697 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 BICDL2A1A5D9 508 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SAC3D1A6NKF1 404 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 NUDT19A8MXV4 375 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 F8W8V4 182 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 BIN1O00499 593 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGAP6O43182 974 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ADCY6O43306 1168 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ANP32CO43423 234 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SCGB1D1O95968 90 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TK1P04183 234 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 NPPBP16860 134 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CHMP24386 653 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CALRP27797 417 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PIK3CGP48736 1102 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MAPKAPK2P49137 400 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CARSP49589 748 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 NKX3-2P78367 333 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MAPKAPK3Q16644 382 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 FLYWCH1Q4VC44 716 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SPECC1Q5M775 1068 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TEPPQ6URK8 271 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MICU3Q86XE3 530 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 LSMEM1Q8N8F7 131 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ATG16L2Q8NAA4 619 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 OR6Y1Q8NGX8 325 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 DPF2Q92785 391 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 DYDC2Q96IM9 177 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 NT5C1BQ96P26 610 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MOGAT1Q96PD6 335 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 FAM83DQ9H4H8 585 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MOCS1Q9NZB8 636 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TMX2Q9Y320 296 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 AKNAQ7Z591 1439 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ATP10BO94823 1461 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 DAPK3O43293 454 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 LY86O95711 162 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 A1BGP04217 495 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 KITP10721 976 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 GUCY1A2P33402 732 aa2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms