RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PROM2Q8N271 834 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 INPP5DQ92835 1189 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ART5Q96L15 291 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 DIABLOQ9NR28 239 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 FBXO40Q9UH90 709 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 NUP50Q9UKX7 468 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CUL7Q14999 1698 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 BTN3A1O00481 513 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 AREL1O15033 823 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ITGB1P05556 798 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ATP6V1E1P36543 226 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ECT2LQ008S8 904 aa6.48□□□□□ -1.37
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PDE4D-216ENST00000507116 ROR1Q01973 937 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 DSG1Q02413 1049 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM32Q13049 653 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 DPP9Q86TI2 863 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PM20D2Q8IYS1 436 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CDCA5Q96FF9 252 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 FAM89AQ96GI7 184 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RRN3Q9NYV6 651 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 FLT1P17948 1338 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MYH7P12883 1935 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 OR5K3A6NET4 321 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF862O60290 1169 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MICAL2O94851 1124 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CD4P01730 458 aa6.48□□□□□ -1.37
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PDE4D-216ENST00000507116 PHKA1P46020 1223 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 STX1BP61266 288 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PLD1Q13393 1074 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TRPC3Q13507 836 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 NCAPHQ15003 741 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ALX1Q15699 326 aa6.48□□□□□ -1.37
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PDE4D-216ENST00000507116 USP37Q86T82 979 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PLEKHF1Q96S99 279 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 LY9Q9HBG7 655 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF175Q9Y473 711 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CPDO75976 1380 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PRRT4C9JH25 899 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PRSS44E7EML9 344 aa6.48□□□□□ -1.37
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PDE4D-216ENST00000507116 SHOXO15266 292 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 USP1O94782 785 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PRKCQQ04759 706 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MAPK6Q16659 721 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 DCAF6Q58WW2 860 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CMTM3Q96MX0 182 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MED15Q96RN5 788 aa6.48□□□□□ -1.37
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