RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 PRR33A8MZF0 331 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 LHX1P48742 406 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 TWF1Q12792 350 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 DUSP4Q13115 394 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 DPH6Q7L8W6 267 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 SPATA18Q8TC71 538 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 DMAC2Q9NW81 257 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 SIX4Q9UIU6 781 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 CDH7Q9ULB5 785 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 ASGR2P07307 311 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 RHOP08100 348 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 LAMP2P13473 410 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 NTHL1P78549 312 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 BIRC3Q13489 604 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 TDGQ13569 410 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 CENPPQ6IPU0 288 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 LEMD2Q8NC56 503 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 MYADMQ96S97 322 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 MMS19Q96T76 1030 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 CORO1BQ9BR76 489 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNK12Q9HB15 430 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPRJQ12913 1337 aa22.64■■□□□ 1.22
SH3BP2-210ENST00000505941 NR2F2P24468 414 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 TSG101Q99816 390 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ACBD6Q9BR61 282 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 DENND4AQ7Z401 1863 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 MTMR11A4FU01 709 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 KRT13P13646 458 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 PCSK1P29120 753 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ATICP31939 592 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 TNNC1P63316 161 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ADAM9Q13443 819 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 STIM1Q13586 685 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 VEPH1Q14D04 833 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 TAF12Q16514 161 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 NFIL3Q16649 462 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 MTSS1LQ765P7 747 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ITIH5Q86UX2 942 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 CXorf38Q8TB03 319 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 FGF13Q92913 245 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM84AQ96KN4 292 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM209Q96SK2 561 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ASAH2Q9NR71 780 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 L1RE1Q9UN81 338 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 YIPF1Q9Y548 306 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ASB3Q9Y575 518 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM221A6NGB7 291 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 M0R296 226 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 MAPK13O15264 365 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 TMC2Q8TDI7 906 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 MYO10Q9HD67 2058 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 IKBKBO14920 756 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ITFG1Q8TB96 612 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF516Q92618 1163 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 SNX25Q9H3E2 840 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 GDE1Q9NZC3 331 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 CETN3O15182 167 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 MICAL2O94851 1124 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 FGF19O95750 216 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM163BP0C2L3 166 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 MYL4P12829 197 aa22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms