RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498562.2

CUL4A-211, Transcript of cullin 4A, humanhuman

TSL 3

Gene CUL4A, Length 790 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4A-211ENST00000498562 E2F7Q96AV8 911 aa28■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 HINFPQ9BQA5 517 aa28■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 MKNK1Q9BUB5 465 aa28■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa28■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 CHRDQ9H2X0 955 aa28■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 CCDC39Q9UFE4 941 aa28■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 TAF6P49848 677 aa27.99■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 TSSK4Q6SA08 328 aa27.99■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 POMGNT1Q8WZA1 660 aa27.99■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 FAM3CQ92520 227 aa27.99■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 CLIC6Q96NY7 704 aa27.99■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 ZSCAN32Q9NX65 697 aa27.99■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 DPP3Q9NY33 737 aa27.99■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 SEL1LQ9UBV2 794 aa27.99■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 DSEQ9UL01 958 aa27.99■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 MYMKA6NI61 221 aa27.98■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 KCNA1Q09470 495 aa27.98■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 FCHO2Q0JRZ9 810 aa27.98■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 SLC39A12Q504Y0 691 aa27.98■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 FAM173BQ6P4H8 233 aa27.98■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 ERMP1Q7Z2K6 904 aa27.98■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 DCLK2Q8N568 766 aa27.98■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 DNAJC19Q96DA6 116 aa27.98■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 DNAH14Q0VDD8 3507 aa27.98■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 CYB561D2O14569 222 aa27.97■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 LILRB5O75023 590 aa27.97■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 RRAGBQ5VZM2 374 aa27.97■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 ITIH5Q86UX2 942 aa27.97■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 ATRIPQ8WXE1 791 aa27.97■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 LPIN3Q9BQK8 851 aa27.97■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 ATXN3LQ9H3M9 355 aa27.97■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 CHADO15335 359 aa27.96■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 FGF19O95750 216 aa27.96■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 ATF6P18850 670 aa27.96■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 SYT1P21579 422 aa27.96■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 GABRR2P28476 465 aa27.96■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 POSTNQ15063 836 aa27.96■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 SV2BQ7L1I2 683 aa27.96■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 YAF2Q8IY57 180 aa27.96■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 RMDN1Q96DB5 314 aa27.96■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 IER2Q9BTL4 223 aa27.96■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 GPR179Q6PRD1 2367 aa27.96■■■□□ 2.07
CUL4A-211ENST00000498562 IL18RAPO95256 599 aa27.95■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 TDGF1P13385 188 aa27.95■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 GAP43P17677 238 aa27.95■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 TXLNAP40222 546 aa27.95■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 TUFMP49411 452 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 CDR1P51861 262 aa27.95■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 WNT7BP56706 349 aa27.95■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 WSCD1Q658N2 575 aa27.95■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 MAMSTRQ6ZN01 415 aa27.95■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 METTL23Q86XA0 190 aa27.95■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 NT5DC4Q86YG4 428 aa27.95■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa27.95■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa27.95■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 TBC1D7Q9P0N9 293 aa27.95■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 CCNE1P24864 410 aa27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 MGAT5BQ3V5L5 792 aa27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 SV2CQ496J9 727 aa27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 GPR158Q5T848 1215 aa27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 LRRTM3Q86VH5 581 aa27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 GPIHBP1Q8IV16 184 aa27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 THEM5Q8N1Q8 247 aa27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 MSANTD3Q96H12 275 aa27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 LRRC3BQ96PB8 259 aa27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 ACCSQ96QU6 501 aa27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 EPC1Q9H2F5 836 aa27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 LMAN1LQ9HAT1 526 aa27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 IL21Q9HBE4 155 aa27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 OLFML3Q9NRN5 406 aa27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 EXOC7Q9UPT5 735 aa27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 DENND4CQ5VZ89 1909 aa27.93■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 KPNA7A9QM74 516 aa27.93■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 GCNT3O95395 438 aa27.93■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 CHRNB1P11230 501 aa27.93■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 CASP5P51878 434 aa27.93■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 CYP4F8P98187 520 aa27.93■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 VEPH1Q14D04 833 aa27.93■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa27.93■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 FAM200AQ8TCP9 573 aa27.93■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 SPPL2BQ8TCT7 592 aa27.93■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 ZNF560Q96MR9 790 aa27.93■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 OBP2AQ9NY56 170 aa27.93■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 A0A087X0B3 334 aa27.92■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 FRMD3A2A2Y4 597 aa27.92■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 SLC38A8A6NNN8 435 aa27.92■■■□□ 2.06
CUL4A-211ENST00000498562 SOX9P48436 509 aa27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms