RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 MYBL1P10243 752 aa4.84□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 C9orf50Q5SZB4 431 aa4.84□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF365Q70YC5 407 aa4.84□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 DHX58Q96C10 678 aa4.84□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 UBAC1Q9BSL1 405 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa4.84□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 VPS41P49754 854 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SERPINB8P50452 374 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 DSC3Q14574 896 aa4.84□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa4.84□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 FAM228AQ86W67 206 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 RASEFQ8IZ41 740 aa4.84□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 CLIC6Q96NY7 704 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 VPS11Q9H270 941 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 C12orf49Q9H741 205 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa4.84□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
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RABGGTB-213ENST00000496055 GREM1O60565 184 aa4.84□□□□□ -1.64
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RABGGTB-213ENST00000496055 KLHDC9Q8NEP7 349 aa4.84□□□□□ -1.64
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RABGGTB-213ENST00000496055 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa4.84□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 BRD9Q9H8M2 597 aa4.84□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa4.84□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa4.84□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TEKT2Q9UIF3 430 aa4.84□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF112Q9ULX5 631 aa4.84□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa4.83□□□□□ -1.64
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