RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 WDR72Q3MJ13 1102 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAF7Q6Q0C0 670 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 TRIM72Q6ZMU5 477 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 PALB2Q86YC2 1186 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 TTC39CQ8N584 583 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 LRRC52Q8N7C0 313 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 ALS2CR12Q96Q35 445 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 OSBPL7Q9BZF2 842 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 ACP6Q9NPH0 428 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 CISHQ9NSE2 258 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 KLK14Q9P0G3 267 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 SALL4Q9UJQ4 1053 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 GIT1Q9Y2X7 761 aa11.46□□□□□ -0.57
ECHDC3-204ENST00000495787 ANO9A1A5B4 782 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 TMCO5BA8MYB1 307 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 URI1O94763 535 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 WEE2P0C1S8 567 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CD58P19256 250 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 GNA15P30679 374 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 TNNC1P63316 161 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 BFSP2Q13515 415 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 TUBB2AQ13885 445 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 GLRA4Q5JXX5 417 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ACAD10Q6JQN1 1059 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF365Q70YC5 407 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM126BQ8IXS8 530 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM130Q8N3G9 435 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF560Q96MR9 790 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 TUBB2BQ9BVA1 445 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 L2HGDHQ9H9P8 463 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC28A3Q9HAS3 691 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 TAS2R14Q9NYV8 317 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.45□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A0U1RQF3 1178 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PIRO00625 290 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PTGESO14684 152 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 THAP12O43422 761 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 BUB1O43683 1085 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 MGEA5O60502 916 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 FTLP02792 175 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PAEPP09466 180 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ACRP10323 421 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 SELPP16109 830 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 LRPAP1P30533 357 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PNPLA4P41247 253 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 TCEAL1Q15170 157 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 AAK1Q2M2I8 961 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF606Q8WXB4 792 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 RFFLQ8WZ73 363 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 HERVK_113Q902F9 699 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PGBD4Q96DM1 585 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ADAM2Q99965 735 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 SDCBP2Q9H190 292 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PDCL3Q9H2J4 239 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 SMYD3Q9H7B4 428 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 UBN1Q9NPG3 1134 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC38A7Q9NVC3 462 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa11.44□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PPEF2O14830 753 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CILPO75339 1184 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CALCAP01258 141 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 UNGP13051 313 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 BMP1P13497 986 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 NOP2P46087 812 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 RAP1GAPP47736 663 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CDH8P55286 799 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 GPC5P78333 572 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 INCA1Q0VD86 236 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 MBTPS1Q14703 1052 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 AGMOQ6ZNB7 445 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 LRRC8DQ7L1W4 858 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 DNAAF5Q86Y56 855 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 RHOT2Q8IXI1 618 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 MYRIPQ8NFW9 859 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 RPS6KC1Q96S38 1066 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 GAD1Q99259 594 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 THAP2Q9H0W7 228 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 IL23AQ9NPF7 189 aa11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms