RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 CCINQ13939 588 aa25.1■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 STXBP5Q5T5C0 1151 aa25.1■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 CENPPQ6IPU0 288 aa25.1■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 SYNPOQ8N3V7 929 aa25.1■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa25.1■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 LRRC3BQ96PB8 259 aa25.1■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 C2orf42Q9NWW7 574 aa25.1■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 CFAP45Q9UL16 551 aa25.1■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.1■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 TTC26A0AVF1 554 aa25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 SFI1A8K8P3 1242 aa25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 MAPTP10636 758 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 ALDH1A3P47895 512 aa25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 MYBPC2Q14324 1141 aa25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 KRT79Q5XKE5 535 aa25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 DTHD1Q6ZMT9 781 aa25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 GAREM2Q75VX8 874 aa25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 KCNK18Q7Z418 384 aa25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 USP37Q86T82 979 aa25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 WDR5BQ86VZ2 330 aa25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM130Q8N3G9 435 aa25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 PSMG2Q969U7 264 aa25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 GTSE1Q9NYZ3 720 aa25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 LAMA1P25391 3075 aa25.08■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 PP2D1A8MPX8 630 aa25.08■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 CLDN3O15551 220 aa25.08■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 SLC26A4O43511 780 aa25.08■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 YEATS4O95619 227 aa25.08■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 FGF19O95750 216 aa25.08■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 CLTAP09496 248 aa25.08■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 PLS3P13797 630 aa25.08■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 WEE1P30291 646 aa25.08■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 LIMK1P53667 647 aa25.08■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 HSFX1Q9UBD0 423 aa25.08■■□□□ 1.61
SIMC1-208ENST00000495423 MTMR11A4FU01 709 aa25.07■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 TYMPP19971 482 aa25.07■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 SMTNP53814 917 aa25.07■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 SPAG1Q07617 926 aa25.07■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 SLC39A14Q15043 492 aa25.07■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 PTPAQ15257 358 aa25.07■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 CEP68Q76N32 757 aa25.07■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.07■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 KCTD17Q8N5Z5 321 aa25.07■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.07■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 KIF12Q96FN5 646 aa25.07■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 ZFYVE19Q96K21 471 aa25.07■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 AK8Q96MA6 479 aa25.07■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 HAPLN2Q9GZV7 340 aa25.07■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 MYO16Q9Y6X6 1858 aa25.06■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 DPYSL4O14531 572 aa25.06■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 PLCB2Q00722 1185 aa25.06■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 PON2Q15165 354 aa25.06■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 IL17AQ16552 155 aa25.06■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 OVOS1Q6IE37 1185 aa25.06■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 DSTYKQ6XUX3 929 aa25.06■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 GPIHBP1Q8IV16 184 aa25.06■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 KCNN1Q92952 543 aa25.06■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 USP28Q96RU2 1077 aa25.06■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 ATXN3LQ9H3M9 355 aa25.06■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa25.06■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa25.06■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 GABRR2P28476 465 aa25.05■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 CDC25AP30304 524 aa25.05■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.05■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa25.05■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 GPR158Q5T848 1215 aa25.05■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.05■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 ITIH5Q86UX2 942 aa25.05■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 ATAD1Q8NBU5 361 aa25.05■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 TTC8Q8TAM2 541 aa25.05■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 LOXL4Q96JB6 756 aa25.05■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 TSPAN18Q96SJ8 248 aa25.05■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.05■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 FAM208BQ5VWN6 2430 aa25.05■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa25.04■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 XPOTO43592 962 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 PPP6R2O75170 966 aa25.04■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 ADRB2P07550 413 aa25.04■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 HOXC13P31276 330 aa25.04■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 KYAT1Q16773 422 aa25.04■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 HYIQ5T013 277 aa25.04■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 TTC9BQ8N6N2 239 aa25.04■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.04■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 BPIFB1Q8TDL5 484 aa25.04■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 CHAMP1Q96JM3 812 aa25.04■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 CLIC4Q9Y696 253 aa25.04■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 CACNA1GO43497 2377 aa25.04■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 NUP205Q92621 2012 aa25.03■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 FRYQ5TBA9 3013 aa25.03■■□□□ 1.6
SIMC1-208ENST00000495423 TM4SF5O14894 197 aa25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.3 ms