RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494136.1

LAMTOR4-212, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, humanhuman

TSL 2

Gene LAMTOR4, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4-212ENST00000494136 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.09□□□□□ -0.95
LAMTOR4-212ENST00000494136 ASAH2Q9NR71 780 aa9.09□□□□□ -0.95
LAMTOR4-212ENST00000494136 GDAP2Q9NXN4 497 aa9.09□□□□□ -0.95
LAMTOR4-212ENST00000494136 EPS15L1Q9UBC2 864 aa9.09□□□□□ -0.95
LAMTOR4-212ENST00000494136 CDH7Q9ULB5 785 aa9.09□□□□□ -0.95
LAMTOR4-212ENST00000494136 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
LAMTOR4-212ENST00000494136 YIPF1Q9Y548 306 aa9.09□□□□□ -0.95
LAMTOR4-212ENST00000494136 ASB3Q9Y575 518 aa9.09□□□□□ -0.95
LAMTOR4-212ENST00000494136 SNX9Q9Y5X1 595 aa9.09□□□□□ -0.95
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 PTPRDP23468 1912 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 MAPK13O15264 365 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 SPTLC1O15269 473 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 RHOP08100 348 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 PRR29P0C7W0 189 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 RFX1P22670 979 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 NR2F2P24468 414 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 ATICP31939 592 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 LHX1P48742 406 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 TWF1Q12792 350 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 TDGQ13569 410 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 WSCD1Q658N2 575 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 TMEM174Q8WUU8 243 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 PGLYRP2Q96PD5 576 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 MMS19Q96T76 1030 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 GDE1Q9NZC3 331 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 FBXL21Q9UKT6 434 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 OBSL1O75147 1896 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 KMT2EQ8IZD2 1858 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 MYH10P35580 1976 aa9.08□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 ATP8B3O60423 1300 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 DENND4CQ5VZ89 1909 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 MTMR11A4FU01 709 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 TMEM221A6NGB7 291 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 M0R296 226 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 PSMA7O14818 248 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 STX10O60499 249 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 ASGR2P07307 311 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 LAMP2P13473 410 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 PIK3CAP42336 1068 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 PNOCQ13519 176 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 NFIL3Q16649 462 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZNF699Q32M78 642 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 SLC39A12Q504Y0 691 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 PDCL2Q8N4E4 241 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 TMC2Q8TDI7 906 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 FGF13Q92913 245 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 MYADMQ96S97 322 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 CORO1BQ9BR76 489 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 GPR88Q9GZN0 384 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 KCTD10Q9H3F6 313 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 KCNK12Q9HB15 430 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 ABCB6Q9NP58 842 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 L1RE1Q9UN81 338 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 DUSP12Q9UNI6 340 aa9.07□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 PTPRJQ12913 1337 aa9.06□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 NOTCH4Q99466 2003 aa9.06□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 CETN3O15182 167 aa9.06□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 MICAL2O94851 1124 aa9.06□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 OR4Q2P0C623 313 aa9.06□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 EPB41P11171 864 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 MYL4P12829 197 aa9.06□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
LAMTOR4-212ENST00000494136 WNT7BP56706 349 aa9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms