RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	CPB1	P15086	417 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	ATIC	P31939	592 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	GCLM	P48507	274 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	NCOA4	Q13772	614 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	UVSSA	Q2YD98	709 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	OSTM1	Q86WC4	334 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	CEP63	Q96MT8	703 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	MTHFR	P42898	656 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	GPR17	Q13304	367 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	LIN9	Q5TKA1	542 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	DPH6	Q7L8W6	267 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	MLKL	Q8NB16	471 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	POMK	Q9H5K3	350 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	GABRD	O14764	452 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	MBD3	O95983	291 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	ADCY1	Q08828	1119 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	HOXA9	P31269	272 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	ELF1	P32519	619 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	GTF2H1	P32780	548 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	NLRP12	P59046	1061 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	RTL10	Q7L3V2	364 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	SPATA18	Q8TC71	538 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	MAFF	Q9ULX9	164 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	C5orf42	Q9H799	3197 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	NOTCH4	Q99466	2003 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	HCRT	O43612	131 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	HLA-DRA	P01903	254 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	ZP2	Q05996	745 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	MMS19	Q96T76	1030 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	CD320	Q9NPF0	282 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	POLI	Q9UNA4	740 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	PRRG1	O14668	218 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	LHX1	P48742	406 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF699	Q32M78	642 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	ACBD6	Q9BR61	282 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	MTMR11	A4FU01	709 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	CCL16	O15467	120 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	LRRN2	O75325	713 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	FAM163B	P0C2L3	166 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	LMO2	P25791	158 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	PIK3CA	P42336	1068 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	CDR1	P51861	262 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	TNNC1	P63316	161 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	KRT39	Q6A163	491 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	SLC35C1	Q96A29	364 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	PIDD1	Q9HB75	910 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		27.65	■■■□□ 2.02

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