RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM187AA6NFU0 413 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD19P15391 556 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATF7IP2Q5U623 682 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAPT1Q6NXT6 567 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOOK3Q86VS8 718 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEC16BQ96JE7 1060 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SETD4Q9NVD3 440 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAPK13O15264 365 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TOM1L1O75674 476 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VIMP08670 466 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TGFB3P10600 412 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDC25CP30307 473 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NSFP46459 744 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CALCOCO2Q13137 446 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LDLRAD1Q5T700 205 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGBL2Q5U5Z8 902 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACAD10Q6JQN1 1059 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APOL6Q9BWW8 343 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBK1Q9UHD2 729 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MROH7Q68CQ1 1323 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM189A1O60320 539 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLTAP09496 248 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RFC5P40937 340 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT17Q04695 432 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP37Q86T82 979 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NLRP7Q8WX94 980 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TFAP2BQ92481 460 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CGRRF1Q99675 332 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WNT8AQ9H1J5 351 aa16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA8SH3BPF8 625 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ECEL1O95672 775 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM191BP0C7N4 346 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLRA4Q5JXX5 417 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCOLN2Q8IZK6 566 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HAUS1Q96CS2 278 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CREB1P16220 341 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPC3Q13507 836 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR72Q3MJ13 1102 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IER5Q5VY09 327 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KAZNQ674X7 775 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD42Q8N9B4 389 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPLOC4Q8TAT6 608 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDT1Q9H211 546 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDHR5Q9HBB8 845 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFT122Q9HBG6 1241 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAM22Q9P0K1 906 aa16.43■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LOC285556D6RIA3 1793 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMPD1P17405 629 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHKAP35790 457 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAS2R40P59535 323 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GCNT1Q02742 428 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LPIN3Q9BQK8 851 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GTF3C4Q9UKN8 822 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STYXL1Q9Y6J8 313 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0G2JMZ2 1700 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1B0GUA9 196 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABLIM1O14639 778 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTNNA2P26232 953 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRYMQ14894 314 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCL14Q16627 93 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLFN12LQ6IEE8 588 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DYDC1Q8WWB3 177 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF606Q8WXB4 792 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPDL1Q96EA4 605 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPS6KC1Q96S38 1066 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAM33Q9BZ11 813 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TXLNGYQ9BZA5 131 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CISHQ9NSE2 258 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PASKQ96RG2 1323 aa16.42■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RASGRF2O14827 1237 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C22orf31O95567 290 aa16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms