RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 E7ENX8 843 aa4.11□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 BRINP1O60477 761 aa4.11□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAP2Q03519 686 aa4.11□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP4.11□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 SQSTM1Q13501 440 aa4.11□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 GTF2H3Q13889 308 aa4.11□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 UGT8Q16880 541 aa4.11□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 CT83Q5H943 113 aa4.11□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 C11orf74Q86VG3 221 aa4.11□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 FKBP10Q96AY3 582 aa4.11□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 MEIS3Q99687 375 aa4.11□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZPBPQ9BS86 351 aa4.11□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCOCQ9UIL1 159 aa4.11□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC28A2O43868 658 aa4.1□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZXDBP98169 803 aa4.1□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 BROXQ5VW32 411 aa4.1□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 STON2Q8WXE9 905 aa4.1□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYOCQ99972 504 aa4.1□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 GREM2Q9H772 168 aa4.1□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFITM10A6NMD0 228 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 B4DGG1 531 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 TOR1BO14657 336 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 SUN1O94901 812 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 ENDOD1O94919 500 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 RHOP08100 348 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 PSG1P11464 419 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 FPR1P21462 350 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADRM1Q16186 407 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC5A5Q92911 643 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 FATE1Q969F0 183 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACAP3Q96P50 834 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM234AQ9H0X4 552 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGSF5Q9NSI5 407 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 KLHL13Q9P2N7 655 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 DPP7Q9UHL4 492 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.09□□□□□ -1.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 QSOX1O00391 747 aa4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 FCHO1O14526 889 aa4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 FKBP9O95302 570 aa4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 ENPP1P22413 925 aa4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCSK6P29122 969 aa4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADCYAP1R1P41586 468 aa4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 FKBP9P1Q75LS8 142 aa4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRRTM3Q86VH5 581 aa4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPEM1Q8N4L4 309 aa4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATRIPQ8WXE1 791 aa4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 EMC7Q9NPA0 242 aa4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACTL7AQ9Y615 435 aa4.08□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC01565O15544 149 aa4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 HAUS5O94927 633 aa4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 ASMTLO95671 621 aa4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 JUPP14923 745 aa4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCSK1P29120 753 aa4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 NPTX2P47972 431 aa4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL2P60568 153 aa4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDK17Q00537 523 aa4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 PDCD1Q15116 288 aa4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP2B3Q16720 1220 aa4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 MUM1L1Q5H9M0 696 aa4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 DACT2Q5SW24 774 aa4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF549Q6P9A3 640 aa4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPM1KQ8N3J5 372 aa4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2W6PQ8NHA6 318 aa4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDYLQ9Y232 598 aa4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP4.07□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A0B4J269 797 aa4.06□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 DSCR3O14972 297 aa4.06□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR32O75388 356 aa4.06□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 USP1O94782 785 aa4.06□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 ALDH9A1P49189 494 aa4.06□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 MTM1Q13496 603 aa4.06□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 TUBB3Q13509 450 aa4.06□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANO4Q32M45 955 aa4.06□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa4.06□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 AHI1Q8N157 1196 aa4.06□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 TSPEARQ8WU66 669 aa4.06□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 AUTS2Q8WXX7 1259 aa4.06□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.06□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 TLR10Q9BXR5 811 aa4.06□□□□□ -1.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPSD1Q9BZJ3 242 aa4.06□□□□□ -1.76
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