RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486274.5

TBC1D23-208, Transcript of TBC1 domain family member 23, human

TSL 5

Gene TBC1D23, Length 4,054 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D23-208	ENST00000486274	AP1G2	O75843	785 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	STAMBP	O95630	424 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	GLI1	P08151	1106 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCL23	P55773	120 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	EFHC2	Q5JST6	749 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCT6B	Q92526	530 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	TLR10	Q9BXR5	811 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	RNF208	Q9H0X6	261 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	DDIT4	Q9NX09	232 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	RECQL4	O94761	1208 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CHRNA3	P32297	505 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	ETFB	P38117	255 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	MARCKSL1	P49006	195 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	TAF6	P49848	677 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	MFSD10	Q14728	455 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	PALB2	Q86YC2	1186 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	VPS52	Q8N1B4	723 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	SPATA20	Q8TB22	786 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	FAM136A	Q96C01	138 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274		M0QYT0	321 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	SP2	Q02086	613 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	DEUP1	Q05D60	604 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	BBOF1	Q8ND07	529 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CDKL2	Q92772	493 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	SEMA4D	Q92854	862 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62	3e-6	■■■■□ 20.8
TBC1D23-208	ENST00000486274	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	UBP1	Q9NZI7	540 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274		F8VP50	259 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	ACKR2	O00590	384 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	BRAF	P15056	766 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	RFX1	P22670	979 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	HSD17B4	P51659	736 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	SESN3	P58005	492 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CUL1	Q13616	776 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	GML	Q99445	158 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CGRRF1	Q99675	332 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	ABCC6	O95255	1503 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	FZD9	O00144	591 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	SPTLC1	O15269	473 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	ARHGAP25	P42331	645 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	OAZ1	P54368	228 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	ROR1	Q01973	937 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCL14	Q16627	93 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	GPATCH11	Q8N954	259 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	PGBD4	Q96DM1	585 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	EPHB2	P29323	1055 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLC29A2	Q14542	456 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	ATL2	Q8NHH9	583 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	MDM1	Q8TC05	714 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZFP42	Q96MM3	310 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	KLC2	Q9H0B6	622 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	PYGM	P11217	842 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	AP3M2	P53677	418 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	SEC24C	P53992	1094 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	POU5F1B	Q06416	359 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRPSAP1	Q14558	356 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	RGMB	Q6NW40	437 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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