RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484897.3

RPSAP58-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 58, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP58, Length 888 nt, Biotype processed pseudogene, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP58-201ENST00000484897 CXorf38Q8TB03 319 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 FGF13Q92913 245 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 TCEAL4Q96EI5 215 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 MCRS1Q96EZ8 462 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 ASIC4Q96FT7 647 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 CGRRF1Q99675 332 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 CEP72Q9P209 647 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 CDH7Q9ULB5 785 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 L1RE1Q9UN81 338 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 HCRTO43612 131 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 HUS1O60921 280 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 CLSTN1O94985 981 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 POU2F2P09086 479 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 MYL4P12829 197 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 GJA1P17302 382 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 PSMD6Q15008 389 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 IQCEQ6IPM2 695 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 CENPPQ6IPU0 288 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 PARM1Q6UWI2 310 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 RTL10Q7L3V2 364 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 LRRTM3Q86VH5 581 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 OSTM1Q86WC4 334 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 NPAS3Q8IXF0 933 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 C12orf56Q8IXR9 622 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 UBALD2Q8IYN6 164 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 LRRC52Q8N7C0 313 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 FGF14Q92915 247 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 HPDLQ96IR7 371 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 KCTD10Q9H3F6 313 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 IGSF9Q9P2J2 1179 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 NUMBLQ9Y6R0 609 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP58-201ENST00000484897 WDFY4Q6ZS81 3184 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 RHOBTB3O94955 611 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 NR3C1P04150 777 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 CFHP08603 1231 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 CCR2P41597 374 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 ALDH1A3P47895 512 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 MYO1EQ12965 1108 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 HTR4Q13639 388 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 CCDC142Q17RM4 750 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 MGAT5BQ3V5L5 792 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 CEP135Q66GS9 1140 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 POTEHQ6S545 545 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 ADGRF2Q8IZF7 708 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 SLC44A3Q8N4M1 653 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 GOLGA5Q8TBA6 731 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 PLEKHO2Q8TD55 490 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 ZNF516Q92618 1163 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 MFSD14AQ96MC6 490 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 KXD1Q9BQD3 176 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 LPIN3Q9BQK8 851 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 ASAH2Q9NR71 780 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 TMLHEQ9NVH6 421 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 ANHXE9PGG2 379 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 PDXKO00764 312 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 CALUO43852 315 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 PHACTR2O75167 634 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 CST3P01034 146 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 EPHB3P54753 998 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 VCPP55072 806 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 MYL7Q01449 175 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 TSPY1Q01534 308 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 FAM160A1Q05DH4 1040 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 PLD1Q13393 1074 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 BIRC3Q13489 604 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 SOWAHAQ2M3V2 549 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 PRSS36Q5K4E3 855 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 CYP4A22Q5TCH4 519 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 FBXL6Q8N531 539 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 STKLD1Q8NE28 680 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 GPR152Q8TDT2 470 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 GIPC2Q8TF65 315 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 ELMO3Q96BJ8 720 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms