RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478196.6

RPS27A-208, Transcript of ribosomal protein S27a, human

TSL 2

Gene RPS27A, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS27A-208	ENST00000478196	SLC5A1	P13866	664 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	PHKA1	P46020	1223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	KCNJ4	P48050	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	TNIP1	Q15025	636 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	MTERF2	Q49AM1	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	DCTPP1	Q9H773	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	GPR108	Q9NPR9	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	AOX1	Q06278	1338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	LPXN	O60711	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	HMMR	O75330	724 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	IGHD	P01880	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	EPHX2	P34913	555 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	BCAR1	P56945	870 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	TTC38	Q5R3I4	469 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	MAFG	O15525	162 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	TOMM70	O94826	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	MCAM	P43121	646 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	PRR16	Q569H4	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	FAM83A	Q86UY5	434 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	AK9	Q5TCS8	1911 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196		H7C1D1	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	NRP1	O14786	923 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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