RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIM49C	P0CI26	452 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEBPB	P17676	345 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	BMP6	P22004	513 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	NR2F2	P24468	414 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	PNPLA4	P41247	253 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCR2	P41597	374 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRCP	P42785	496 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	RBP5	P82980	135 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	TWF1	Q12792	350 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPR17	Q13304	367 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	SURF1	Q15526	300 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTPN21	Q16825	1174 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEP135	Q66GS9	1140 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	TPGS2	Q68CL5	300 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	FNBP1	Q96RU3	617 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	PKMYT1	Q99640	499 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	UST	Q9Y2C2	406 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		11.96	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	XYLB	O75191	536 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRG1	P02750	347 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	RHO	P08100	348 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATF6	P18850	670 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	FSHR	P23945	695 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPR15	P49685	360 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYL6	P60660	151 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	DUSP4	Q13115	394 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYBPC2	Q14324	1141 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	NFIL3	Q16649	462 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	CENPP	Q6IPU0	288 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMARCE1	Q969G3	411 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	HPDL	Q96IR7	371 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	GSDMA	Q96QA5	445 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	DSE	Q9UL01	958 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	NCAN	O14594	1321 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	BIN1	O00499	593 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRN2	O75325	713 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	MOSPD3	O75425	235 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	GJA1	P17302	382 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	ELF1	P32519	619 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLDN10	P78369	228 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZXDA	P98168	799 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	UVSSA	Q2YD98	709 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	METTL23	Q86XA0	190 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMC8	Q8IU68	726 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	FGF13	Q92913	245 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	CORO1B	Q9BR76	489 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRC3	Q9BY71	257 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	RMND1	Q9NWS8	449 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIO	O75962	3097 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	GABRD	O14764	452 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-208	ENST00000475959	HUS1	O60921	280 aa		11.93	□□□□□ -0.5

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