RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
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PRPF40A-208ENST00000472760 MED15Q96RN5 788 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-208ENST00000472760 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-208ENST00000472760 RNF181Q9P0P0 153 aa5.92□□□□□ -1.46
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PRPF40A-208ENST00000472760 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-208ENST00000472760 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa5.92□□□□□ -1.46
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PRPF40A-208ENST00000472760 TNFSF4P23510 183 aa5.91□□□□□ -1.46
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PRPF40A-208ENST00000472760 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa5.91□□□□□ -1.46
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PRPF40A-208ENST00000472760 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.89□□□□□ -1.47
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PRPF40A-208ENST00000472760 CHRM3P20309 590 aa5.89□□□□□ -1.47
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PRPF40A-208ENST00000472760 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-208ENST00000472760 KCNE5Q9UJ90 142 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-208ENST00000472760 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-208ENST00000472760 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa5.89□□□□□ -1.47
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PRPF40A-208ENST00000472760 GAGE12BA1L429 117 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-208ENST00000472760 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-208ENST00000472760 APOL1O14791 398 aa5.88□□□□□ -1.47
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