RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF165P49910 485 aa23.31■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 CLCN4P51793 760 aa23.31■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 RAB33AQ14088 237 aa23.31■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 HLA-CQ95604 372 aa23.31■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 PES1O00541 588 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 ELF1P32519 619 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 ADAM15Q13444 863 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 SOWAHAQ2M3V2 549 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 LIN9Q5TKA1 542 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 IRF2BP1Q8IU81 584 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 HDAC7Q8WUI4 952 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 FAXDC2Q96IV6 333 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 FUCA2Q9BTY2 467 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 COQ4Q9Y3A0 265 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 TACC1O75410 805 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 WARSP23381 471 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 ROR1Q01973 937 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 COL19A1Q14993 1142 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 TCP11X2Q5H9J9 407 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 TPGS2Q68CL5 300 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 SCARA3Q6AZY7 606 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 PI4K2AQ9BTU6 479 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 FANCLQ9NW38 375 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 TGM5O43548 720 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 TBC1D4O60343 1298 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 EPCAMP16422 314 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 SMARCB1Q12824 385 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 CDKAL1Q5VV42 579 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 TTC39CQ8N584 583 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 OR6B3Q8NGW1 331 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 ACBD6Q9BR61 282 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 MAN1C1Q9NR34 630 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 MAFFQ9ULX9 164 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 POLIQ9UNA4 740 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 LINC01565O15544 149 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 VWA3BQ502W6 1294 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC149Q6ZUS6 474 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 LIMS2Q7Z4I7 341 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 KREMEN2Q8NCW0 462 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF461Q8TAF7 563 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 NT5C1BQ96P26 610 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 SFXN1Q9H9B4 322 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 THEGQ9P2T0 379 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-212ENST00000472427 A8MXQ7 604 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 PRRG1O14668 218 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 GABRDO14764 452 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 ADAM12O43184 909 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 GLP2RO95838 553 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 KCNA5P22460 613 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 GPR17Q13304 367 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 AAK1Q2M2I8 961 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 GBP6Q6ZN66 633 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 SEMA4DQ92854 862 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 NDST4Q9H3R1 872 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 GCNT4Q9P109 453 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 CDH9Q9ULB4 789 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 MYO7AQ13402 2215 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 WDR27A2RRH5 827 aa23.25■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa23.25■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 ASPAP45381 313 aa23.25■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 KCNC3Q14003 757 aa23.25■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC39A12Q504Y0 691 aa23.25■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 ANKRD54Q6NXT1 300 aa23.25■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 LILRA6Q6PI73 481 aa23.25■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 RTL10Q7L3V2 364 aa23.25■■□□□ 1.31
RALGPS1-212ENST00000472427 VN1R2Q8NFZ6 395 aa23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms