RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469303.1

SRSF10-208, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 10, human

TSL 3

Gene SRSF10, Length 413 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRSF10-208	ENST00000469303	SLC11A2	P49281	568 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	MAN2A2	P49641	1150 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	CASP5	P51878	434 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	ZNF134	P52741	427 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	CTSW	P56202	376 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	SLC13A2	Q13183	592 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	CRHR2	Q13324	411 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	FZD5	Q13467	585 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	PICALM	Q13492	652 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	PMS2P11	Q13670	270 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	RNF152	Q8N8N0	203 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303		Q8NA96	180 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	PHKB	Q93100	1093 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	C18orf8	Q96DM3	657 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	KLC2	Q9H0B6	622 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	GPR35	Q9HC97	309 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	WIZ	O95785	1651 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303		A0A1B0GTW7	788 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303		K7ESM1	405 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	MGEA5	O60502	916 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	ARIH2	O95376	493 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	GNAI3	P08754	354 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	TSHR	P16473	764 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	ABCB4	P21439	1286 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	TNFSF4	P23510	183 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	HSPA1L	P34931	641 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	IL12RB1	P42701	662 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	ITGA8	P53708	1063 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	CACNB3	P54284	484 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	KRTAP10-2	P60368	255 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	GNAI1	P63096	354 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	HTR3D	Q70Z44	454 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	FAM167A	Q96KS9	214 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	SGCZ	Q96LD1	299 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	ADAM2	Q99965	735 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	CEP72	Q9P209	647 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	MED16	Q9Y2X0	877 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	ADAMTS12	P58397	1594 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	PLIN1	O60240	522 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	SUN1	O94901	812 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	NDUFA10	O95299	355 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	PDHA1	P08559	390 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	ALAS1	P13196	640 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	PHKG2	P15735	406 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	ZNF20	P17024	532 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	STT3A	P46977	705 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	TM4SF4	P48230	202 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	LILRA4	P59901	499 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	BIRC2	Q13490	618 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	GEN1	Q17RS7	908 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	FAM209B	Q5JX69	171 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	EMC10	Q5UCC4	262 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SRSF10-208	ENST00000469303	UNC13D	Q70J99	1090 aa		3.73	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms