RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468534.1

CCDC88A-210, Transcript of coiled-coil domain containing 88A, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC88A, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88A-210ENST00000468534 MARCH11A6NNE9 402 aa5.56□□□□□ -1.52
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CCDC88A-210ENST00000468534 NEMP1O14524 444 aa5.56□□□□□ -1.52
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CCDC88A-210ENST00000468534 NOX1Q9Y5S8 564 aa5.56□□□□□ -1.52
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CCDC88A-210ENST00000468534 RASSF1Q9NS23 344 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 KLHL11Q9NVR0 708 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 DCAF16Q9NXF7 216 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 COX11Q9Y6N1 276 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 KAT6BQ8WYB5 2073 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 SMTNL1A8MU46 457 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 J3KRW8 73 aa5.54□□□□□ -1.52
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CCDC88A-210ENST00000468534 APAF1O14727 1248 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 ULK1O75385 1050 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 ARIH2O95376 493 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 FDXRP22570 491 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 ECHS1P30084 290 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 PER3P56645 1201 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 SESN3P58005 492 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 BLOC1S1P78537 153 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 MTMR1Q13613 665 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 ANKRD45Q5TZF3 282 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC88A-210ENST00000468534 AFMIDQ63HM1 303 aa5.54□□□□□ -1.52
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