RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463615.1

PDLIM4-205, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

TSL 2

Gene PDLIM4, Length 582 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-205ENST00000463615 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 E2F7Q96AV8 911 aa22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 SAAL1Q96ER3 474 aa22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 FGF19O95750 216 aa22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 F13A1P00488 732 aa22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 PSMC3P17980 439 aa22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 WSCD1Q658N2 575 aa22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 ITIH5Q86UX2 942 aa22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 GPD1LQ8N335 351 aa22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 SPATA18Q8TC71 538 aa22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 SHISA7A6NL88 538 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 WEE1P30291 646 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 EHHADHQ08426 723 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 TEAD2Q15562 447 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 VITQ6UXI7 678 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 C1orf210Q8IVY1 113 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 IRF7Q92985 503 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 CLDN23Q96B33 292 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 FAM186AA6NE01 2351 aa22.14■■□□□ 1.14
PDLIM4-205ENST00000463615 GJA1P17302 382 aa22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 HOXD13P35453 343 aa22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 GAREM2Q75VX8 874 aa22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 DHX58Q96C10 678 aa22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 DMDP11532 3685 aa22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 COL4A2P08572 1712 aa22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 F5P12259 2224 aa22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 A0A1W2PRU2 124 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ITGB3P05106 788 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 SURF1Q15526 300 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 TPRG1Q6ZUI0 275 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 BCO2Q9BYV7 579 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 BRD9Q9H8M2 597 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 HEBP1Q9NRV9 189 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 COL4A3Q01955 1670 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 UBE4BO95155 1302 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 TCHHQ07283 1943 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 FAM170BA6NMN3 283 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ARNTLO00327 626 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 MAN2B1O00754 1011 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 LRRN2O75325 713 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ATF6P18850 670 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 VIPR2P41587 438 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ASIC1P78348 528 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 RBP5P82980 135 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 GRM2Q14416 872 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 RESP18Q5W5W9 173 aa22.12■■□□□ 1.13
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