RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF560Q96MR9 790 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 INTS13Q9NVM9 706 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 USP25Q9UHP3 1055 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 SIX4Q9UIU6 781 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 YIPF1Q9Y548 306 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 ASB3Q9Y575 518 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 SCN1AP35498 2009 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 UBE4BO95155 1302 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 KLRC4O43908 158 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 CEBPBP17676 345 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 ALDH1A3P47895 512 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 TUFMP49411 452 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 EPHB3P54753 998 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 RBP5P82980 135 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 FLCNQ8NFG4 579 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM174Q8WUU8 243 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 ING5Q8WYH8 240 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 ELSPBP1Q96BH3 223 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 SPATA32Q96LK8 384 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 GPR88Q9GZN0 384 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GVL5 298 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 MYL1P05976 194 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 PFKFB1P16118 471 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 STARD6P59095 220 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 PSMD2Q13200 908 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 DPH6Q7L8W6 267 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 LIMS2Q7Z4I7 341 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 TMC8Q8IU68 726 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 SPATA18Q8TC71 538 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 PSMG2Q969U7 264 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 ASB16Q96NS5 453 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 ACBD6Q9BR61 282 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 ASAH2Q9NR71 780 aa14.23□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 PTPRJQ12913 1337 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 GABRDO14764 452 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 MYL4P12829 197 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 FCARP24071 287 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 MRE11P49959 708 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 PFKPQ01813 784 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 STK4Q13043 487 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 WDR49Q8IV35 697 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 SHKBP1Q8TBC3 707 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 SHDQ96IW2 340 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 FAM84AQ96KN4 292 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 KXD1Q9BQD3 176 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 CA14Q9ULX7 337 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 L1RE1Q9UN81 338 aa14.22□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1W2PQ27 194 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1W2PQ64 194 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1W2PQD8 194 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 CLIC2O15247 247 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 HUS1O60921 280 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf3-210ENST00000462125 KRT19P08727 400 aa14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms