RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 WEE2P0C1S8 567 aa21.64■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 ARSEP51690 589 aa21.64■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 OGDHQ02218 1023 aa21.64■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 STAT4Q14765 748 aa21.64■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.64■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.64■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.64■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.64■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 FAM189A1O60320 539 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 ETS1P14921 441 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 BAG6P46379 1132 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 EFNA5P52803 228 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 TRPC3Q13507 836 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 TREML2Q5T2D2 321 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 RELL1Q8IUW5 271 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 CCHCR1Q8TD31 782 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 ABCF3Q9NUQ8 709 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 LGALS13Q9UHV8 139 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 STX2P32856 288 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 XRCC4Q13426 336 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 TMED2Q15363 201 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 SGSM3Q96HU1 749 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 MAF1Q9H063 256 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 CD248Q9HCU0 757 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 GGT7Q9UJ14 662 aa21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 LRRD1A4D1F6 860 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 PLCB3Q01970 1234 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 GPS1Q13098 491 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 NEDD9Q14511 834 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 LY6KQ17RY6 165 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 PARP9Q8IXQ6 854 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 RNF149Q8NC42 400 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 CKAP2Q8WWK9 683 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.051e-8■□□□□ 11.3
IMP4-208ENST00000460766 SLC12A4Q9UP95 1085 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 MCL1Q07820 350 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 ERICH1Q86X53 443 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 ALLCQ8N6M5 410 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 BTBD7Q9P203 1132 aa21.62■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 RASA4BC9J798 803 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 OGTO15294 1046 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 RASA4O43374 803 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 PRKCBP05771 671 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 ZNF699Q32M78 642 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 LRRC38Q5VT99 294 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 LBX2Q6XYB7 198 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 CEP128Q6ZU80 1094 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 TFAP2BQ92481 460 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 FOXP3Q9BZS1 431 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 CEP83Q9Y592 693 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 SOWAHBA6NEL2 793 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 OAS1P00973 400 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 OSTNP61366 133 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 GRM1Q13255 1194 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 MAPK6Q16659 721 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 TFDP3Q5H9I0 405 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 POTEAQ6S8J7 498 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 TRIM50Q86XT4 487 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 SUN1O94901 812 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 IFNB1P01574 187 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 GSTA1P08263 222 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 SNCBQ16143 134 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 CAPN12Q6ZSI9 719 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 TMEM121Q9BTD3 319 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms