RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa24.75■■□□□ 1.55
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PTPN4-208ENST00000460289 GDE1Q9NZC3 331 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 SIX4Q9UIU6 781 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 YIPF1Q9Y548 306 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 MTMR11A4FU01 709 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 VNN2O95498 520 aa24.74■■□□□ 1.55
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PTPN4-208ENST00000460289 SLC39A12Q504Y0 691 aa24.74■■□□□ 1.55
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PTPN4-208ENST00000460289 CEP72Q9P209 647 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 NUMBLQ9Y6R0 609 aa24.74■■□□□ 1.55
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PTPN4-208ENST00000460289 TOP6BLQ8N6T0 577 aa24.73■■□□□ 1.55
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PTPN4-208ENST00000460289 ASAH2Q9NR71 780 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 SNX9Q9Y5X1 595 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 PTPRJQ12913 1337 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 PRR29P0C7W0 189 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 TSPY1Q01534 308 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 SLC5A9Q2M3M2 681 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 PRSS36Q5K4E3 855 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 PARM1Q6UWI2 310 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 DPH6Q7L8W6 267 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 SLC9A9Q8IVB4 645 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 PDCL2Q8N4E4 241 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 ING5Q8WYH8 240 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 HPDLQ96IR7 371 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 CGRRF1Q99675 332 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 CRISPLD1Q9H336 500 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 WNT16Q9UBV4 365 aa24.72■■□□□ 1.55
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PTPN4-208ENST00000460289 L1RE1Q9UN81 338 aa24.72■■□□□ 1.55
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PTPN4-208ENST00000460289 SPPL2BQ8TCT7 592 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 FGF14Q92915 247 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 MCRS1Q96EZ8 462 aa24.71■■□□□ 1.55
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PTPN4-208ENST00000460289 KCTD10Q9H3F6 313 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPN4-208ENST00000460289 MFSD1Q9H3U5 465 aa24.71■■□□□ 1.55
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PTPN4-208ENST00000460289 ITIH5Q86UX2 942 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPN4-208ENST00000460289 LRRTM3Q86VH5 581 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPN4-208ENST00000460289 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PTPN4-208ENST00000460289 NOTCH4Q99466 2003 aa24.69■■□□□ 1.54
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PTPN4-208ENST00000460289 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PTPN4-208ENST00000460289 PRRX2Q99811 253 aa24.69■■□□□ 1.54
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PTPN4-208ENST00000460289 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
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PTPN4-208ENST00000460289 SOWAHAQ2M3V2 549 aa24.68■■□□□ 1.54
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PTPN4-208ENST00000460289 ADGRF2Q8IZF7 708 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPN4-208ENST00000460289 PSMG2Q969U7 264 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPN4-208ENST00000460289 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PTPN4-208ENST00000460289 GPR88Q9GZN0 384 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPN4-208ENST00000460289 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPN4-208ENST00000460289 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPN4-208ENST00000460289 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPN4-208ENST00000460289 TSC2P49815 1807 aa24.68■■□□□ 1.54
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